水稻是世界上最重要的粮食作物之一,为全球贡献了超过30%的能量摄入。由稻瘟菌（Magaporthe oryzae）引发的稻瘟病是水稻上最重要的三大病害之一,严重威胁稻谷的产量。目前,稻瘟病的防治主要于依赖栽培抗病品种和使用化学药剂。由于该病原菌容易发生变异,所以抗病品种极易丧失抗性。长时间使用单一的化学药剂则会使病原菌产生抗药性,导致药效丧失。因此,如何提高水稻对稻瘟病的持久抗性,是我们国家粮食安全生产上的难题。在植物和病原菌互作过程中,越来越多的证据表明小分子RNAs能够参与植物抗性免疫反应。水稻中,已有许多microRNAs报道能够参与抗稻瘟菌的免疫调节,但是小分子RNAs抗稻瘟菌的分子机制目前还不是很清楚。因此,了解水稻对稻瘟菌的抗性机制,在科学和经济上都具有重要意义。本论文主要对稻瘟菌（Guy11）侵染的水稻（Nipponbare）样品的小分子RNAs进行高通量测序,构建小分子RNAs表达文库;挑选差异表达显著的小分子RNAs进行Northern blot验证,筛选参与抗稻瘟菌免疫过程中的小分子RNAs;并对小分子RNAs和其靶标基因在抗稻瘟免疫中的功能进行分析,获得的主要研究结果如下:本研究首先对构建的表达文库中具有显著变化的小分子RNAs进行验证,发现osa-miR164a在稻瘟菌Guy11侵染早期和晚期都会下调表达。通过本氏烟瞬时表达,发现osa-miR164a能够抑制其靶标基因OsNAC60的表达。过表达osa-miR164a和沉默osnac60,miR1 64a/OsNAC60调控模型发生紊乱,水稻对稻瘟菌敏感性增强。显微观察发现,过表达osa-miR164a和沉默osnac60株系中侵染菌丝的扩展相比野生型更严重。在烟草叶片中过表达OsNAC60,发现能够诱导强烈的细胞坏死,诱导活性氧的迸发,胼胝质的积累,以及防卫相关基因NbPR1b,NbERF1,NbAcre31的表达,然而OsNAC60和osa-miR164a共表达时,OsNAC60引起的细胞坏死及免疫反应会受到抑制。同时,在多种植物-病原菌互作体系中,例如水稻/丝核菌,番茄/致病疫霉,大豆/大豆疫霉中,我们均发现相同的表达模式,即病原菌侵染后,osa-miR164a的前体会下调表达,而其靶标基因NAC会上调表达,表明miR1 64a/OsNACs调控模型可被多种病原菌激活。我们的结论表明,miR1 64a/OsNAC60调控模型调控水稻抗稻瘟菌的免疫;miR164a通过抑制NACs的表达,负调控植物免疫反应;miR1 64a/NACs作为一种基础免疫调节模型,广泛的存在于多种植物和病原菌互作体系中。我们还发现了另一个从来没有报道过功能的小分子RNA,osa-miR1436。在稻瘟菌侵染过程中,osa-miR1436会上调表达,其通过靶标OsMLO11的3’UTR区域,负调控靶标基因OsMLO11的表达。通过喷雾接种和菌丝球离体接种发现,过表达miR1436和沉默osmlo11会增强水稻对稻瘟菌的抗性,过表达OsMLO11会增强水稻对稻瘟菌的敏感性;主要体现在病斑分级,活性氧的迸发,胼胝质的积累,游离态水杨酸含量以及防卫相关基因的表达上。显微观察发现,过表达miR1436或沉默osmlo11会抑制附着孢的萌发及侵入菌丝的扩展。野生型叶鞘细胞中没有活性氧的积累,但是miR1436过表达及osmlo11沉默株系中,有侵入菌丝扩展的叶鞘细胞中会有活性氧的积累。苯胺蓝染色,结果发现miR1436过表达和osmlo11沉默株系中胼胝质的积累比对照株系要多,OsMLO11过表达株系中胼胝质的积累比对照要少;这一结果表明过表达miR1436或沉默osmlo11,会通过诱导活性氧的迸发,胼胝质的积累抵御病原菌的侵染,从而使水稻对稻瘟病表现为抗病。对防卫相关基因进行检测,发现在病原菌侵染过程中,相比较OsMLO11过表达株系,过表达miR1436及沉默osmlo11,防御相关基因OsPAL1,OsNPR1,OsPR1a,OsPR1b,OsPBZ1显著诱导表达;这些结果表明miR1436通过影响SA信号通路,调节水稻对稻瘟菌的抗性。在没有病原菌侵染的状态下,植物处于低免疫的状态,利于自身的生长发育;当稻瘟菌侵染时,miR1436会上调表达,降解OsMLO11,通过诱导活性氧的迸发,胼胝质的积累,增加游离态水杨酸含量以及影响SA信号通路来激活植物免疫反应,从而抑制病原菌的侵染。总而言之,我们的结论表明,miR1436通过调节OsMLO11的表达,正调控水稻抗稻瘟菌的免疫。