自上世纪80年代改革开放以来，我国的经济、政治、社会体制得到极大改善，非营利组织获得相当大的发展空间。非营利组织发展迅速，在各行各业发挥着作用。为经济社会发展提供力量。但是非营利组织自身也存在很多的不足，弊端日益显现，尤其是非营利组织在资金运作中的违规和腐败行为日益严重。由于我国的社会监督体制还不完善，所以对非营利组织的监管主要是靠政府来进行。有关如何防止非营利组织资金滥用，政府加强资金监管的研究和实践尚少。本文着眼于非营利组织资金监管问题，首先在对非营利组织及政府监管概念研究的基础上，首先阐明政府监管的必要性，又从公共责任、委托一代理理论的视角对我国非营利组织监督机制的构建做了理论依据上的分析。立足我国实际情况，对我国政府在非营利组织资金监管方面的进行分析研究、从监管主体、法律法规、税收制度和政府审计四个方面分析了我国政府对非营利组织的资金监管所存在的问题及产生原因。又通过对英美两国政府对非营利组织的管理进行分析，总结出其在法律框架和政府规制、社会监督、税收制度等方面的优势，从而为我国非营利组织资金监管体系的建设提供借鉴。最后，经过研究分析，从管理体制、法律法规、税收制度、政府审计四方面提出了完善我国政府对非营利组织资金监管的对策。