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茶树内生真菌是指生长在茶树健康组织内的一般不会引起茶树发生明显病变的真菌。基于不同茶树品种、不同的栽培条件以及地理气候等因素,茶树中的内生真菌形成了特定的群落结构,并具有一定的微生物多样性。将传统的微生物分离培养方法与现代高通量测序技术结合起来,可以使得研究结果更加可靠、全面。本文主要对不同品种茶树(同一地理不同品种、同一品种不同地理)的内生真菌进行了分离纯化、分子生物学鉴定及群落结构的分析,同时选择舒城916茶场的舒茶早品种,利用高通量测序技术,较为全面、系统地对跨越60年的不同年龄段茶树进行了内生真菌多样性及群落结构的分析。具体研究结果如下:1.不同品种茶树内生真菌的分离纯化与群落结构的分析。从不同地理位置的12个不同茶树品种样品中共分离出真菌菌株1 7种属,包括刺盘孢属(Colletotrichum)、芒果球座菌(Guignardia mangiferae)、链格孢属(Alternaria)、拟茎点霉属(Phomopsis)、青霉属(Penicillium)、花斑曲霉(Aspergillus versicolor)、灰葡萄孢霉(Botryotinia fuckeliana)、假球壳目(Pleosporales)、围小丛壳菌(Glomerella cingulata)、枝孢属(Cladosporium sp.)、间座壳属(Diaporthe eucalyptorum)、拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis sp.)、横断孢属(Strelitziana sp.)、木霉属(Trichoderma sp.)、子囊菌属(Ascomycota)以及两种未知菌株。其中刺盘孢属真菌(尤以胶孢炭疽菌)、芒果球座菌、链格孢属真菌是这些茶树品种的中最丰富、最具有优势的菌群。样品中,对于同一地理不同品种的茶树而言,大多数样品的中层叶、和下层叶的内生真菌分离率较上层叶内生真菌分离率高,不同叶层所分离得到的内生真菌种数无明显差异;对于同一品种不同地理的茶树而言,合肥大杨店的茶树在分离率以及分离菌株种数上要高于东至县和舒城县。2.高通量测序方法分析不同树龄舒茶早内生真菌多样性利用高通量测序技术对四种树龄(1-2年生、20年生、40年生、60年生)的舒城舒茶早叶片和土壤内生真菌进行多样性分析以及群落结构的研究中,得到了样品内生真菌在门、纲、目、科、属各水平上的群落组成。其中,在属的分类水平上丰度前10的物种分别为:覆膜孢酵母属(Saccharomycopsis)、枝孢属(Cladosporium)、横断孢属(Strelitziana)、Pseudoramichloridium、Zymoseptoria、Penicillifer、木霉属(Trichoderma)、假散囊菌属(Pseudeurotium)、拟盾壳霉属(Paraconiothyrium)、Melanconiella。枝孢属(Cladosporium)、横断孢属(Strelitziana)以及 Zymoseptoria属真菌具有优势。土壤中内生真菌丰度和多样性高于叶片,不同树龄舒茶早内生真菌数量和种类各不相同。其中尤以60年生舒茶早根际土壤内生真菌丰度和多样性最高,枝孢属(Cladosporium)、横断孢属(Strelitziana)、Zymoseptoria真菌在叶片中的丰度显著高于土壤中,横断孢属(Strelitziana)真菌的丰度和叶层的成熟程度与茶树的年龄有关且呈正相关;Zymoseptoria真菌丰度与茶树的年龄有关且呈减少趋势。舒茶早年龄越相近,物种多样性方面存在的差异性越小,年龄相近的条件下,年龄越大,物种多样性方面存在的差异越小。