长链非编码RNA SIGLEC17P在肺腺癌中的诊断预后价值及其初步功能研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fskfxx
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目的:探讨lnc RNA(long non-coding RNA,长链非编码RNA)SIGLEC17P在LUAD(lung adenocarcinoma,肺腺癌)中表达情况、临床价值及其初步生物学功能影响。方法:首先,通过生物信息学方法预测SIGLEC17P表达情况与肺腺癌患者预后相关性,采用Cox回归分析检测独立的预后危险因素,ROC(Receiver Operating Characteristic,受试者操作特征曲线)评价差异基因对肿瘤的诊断价值和Kaplan-Meier(K-M)生存分析预测高低表达组生存曲线。利用DAVIAD构建SIGLEC17P相关基因的GO(Gene Ontology,基因本体)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因与基因组百科全书)分析以探测相关可能机制。随后,由q RT-PCR(quantitative real-time PCR,实时荧光定量PCR)检测了SIGLEC17P在肺腺癌及癌旁组织的表达情况,分别采用卡方分析及与ROC曲线评价SIGLEC17P表达水平与临床病理特征的相关性及其因对肿瘤的诊断价值。最终,构建过表达SIGLEC17P慢病毒载体,感染肺腺癌细胞A549细胞,构建稳定表达细胞株,通过CCK8实验、划痕实验、侵袭实验,检测过表达SIGLEC17P对A549增殖、迁移、侵袭能力的影响。结果:Ualcan筛选并TCGA验证得到9个预后相关低表达lnc RNA(LINC00092,LINC00908,WWC2-AS2,RPL13AP17,CHIAP2,SFTA1P,SIGLEC17P,CYP2B7P1,CYP4Z2P)。卡方分析筛选出与临床病理特征最具有代表性的SIGLEC17P。多因素Cox回归分析显示SIGLEC17P作为肺腺癌患者OS及RFS的独立预后危险因素。同时,ROC曲线分析显示SIGLEC17P具有很强的诊断价值。GO和KEGG分析显示主要富集MHC II类抗原处理和提呈肽或多糖抗原等通路相关。QRT-PCR结果显示SIGLEC17P相对于癌旁组织在肺腺癌组织中低表达,并与N分期、T分期和TNM分期相关,通过ROC曲线可知其具有良好的诊断价值。SIGLEC17P抑制A549细胞增殖、迁移及侵袭。结论:SIGLEC17P在肺腺癌组织中低表达,并且与临床病理分期密切相关,具有良好的诊断价值。过表达SIGLEC17P的A549细胞抑制细胞增殖、迁移及侵袭,能够成为肺腺癌的诊断及预后潜在标志物。
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