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我国国家级高新技术产业园区的效率评价面临现实的新变化:双循环经济、中美贸易战和新冠疫情。重新评估国家级高新技术开发区的效率是非常重要,以顺应现实的新变化。内生性理论表明四种情形将带来内生性问题:(1)解释变量与其他解释变量相关,这造成某个解释变量与误差项相关,从而出现内生性问题。(2)解释变量与被解释变量互为因果,甚至出现动态反馈机制,而传统计量模型要求解释变量严格外生假设。违背假设将带来内生性问题。(3)测量误差:由于各种原因解释变量测量值与真实数值之间或多或少出现差异,这是误差项的一部分,进而导致内生性问题。(4)解释变量与被解释变量的反向因果关系。已有研究表明市场结构、创新和政策变迁等等是国家级高新技术产业园区效率评估的决定因素。然而相关效率评估研究却长期忽视国家级高新技术产业园区效率评估的内生性问题。理论和实践都表明创新活动的协同合作、产业集群创新和创新的外溢效应、市场结构和制度变迁以及它们与国家级高新技术产业园区效率的反馈机制等等是内生性效率重要机制。本研究试图构建国家级高新技术产业园区内生性效率评估理论和实证框架。本研究基于国家级高新技术产业园区发展新变化:中美间贸易战和科技战方兴未艾;新冠疫情仍然肆虐;中国经济双循环以及计量经济学内生性理论,构建内生性效率理论框架。提出创新活动、市场结构和制度变迁等高新区内生性效率逻辑。这为国家级高新技术产业园区效率评估提供新的理论视角和理论框架。它更多地从高新区发展本身研究效率的变化,更多地从高新区的经济逻辑思考效率的变动,从而打破传统评价方法只是纯粹依据数量关系从统计角度研究高新区效率的理论方法。内生性效率评价能够更加全面准确地反映运行效率,丰富效率评价理论,完善高新区效率评估的研究框架。同时,本研究提供可供操作的应用研究框架。基于解释变量之间的关联和解释变量与被解释变量的因果关系等高新区效率形成过程进行内生性效率评估,而不是仅仅基于解释变量和被解释变量的纯粹数量统计关系评估效率。从经济和产业角度研究创新活动、市场结构和制度变迁等内生因素与国家级高新技术园区的效率的关联。进而重新评估创新活动、市场结构和制度变迁在高新区的内生影响。相关研究结果将给政府宏观政策制定提供了一定的参考依据。主要实证研究发现如下:(1)国家级高新技术开发区的内生性效率研究是必要的,内生性模型提高解释变量例如创新水平、市场结构、制度变迁的估计系数、显著性水平和影响作用。(2)理论及实证表明创新水平、市场结构、制度变迁、研发支出和研发人员等高新产业园区效率内生影响因素。纠正内生性后,创新水平、市场结构、制度变迁等因素提高国家级高新技术开发区的非效率解释能力。(3)使用科技活动费用支出和高级职称人员作为研发费用和研发人员的工具变量能够有效地解决内生性问题,模型估计效率均值显著增加。这意味着传统研究方法存在低估高新产业园区效率;(4)创新水平门槛效应明显,创新水平在高新产业园区效率评估影响是最大的,纠正内生性问题后创新水平对效率解释能力显著提高。但是在创新水平比较高时边际作用下降。(5)运用工业总产值作为产出衡量检验模型结论稳健性,结论基本不变。未来研究应优化工具变量的选择提高研究的稳健性。为此,政府需要通过优化市场结构、良好的制度变迁和创新水平管理提高国家级高新技术开发区效率。未来应优化工具变量的选择以提高实证研究的稳健性。为此,政府需要通过优化市场结构、良好的制度变迁和创新水平管理提高,运用大资金战略和投资未来的战略来提高新产业园区效率。