近年来,随着国际市场竞争逐步加剧、消费需求日益提高以及食用菌生产加工技术快速进步,食用菌供应链分散、独立以及小规模的生产、加工和分销的现状,越来越不利于食用菌产业高效持续稳定的发展。因此,优化食用菌供应模式,提高供应链运作效率成为产业发展的关键问题。食用菌供应链包括了生产、加工、销售等环节,涉及众多参与主体。而菇农作为供应链上游的参与主体,在供应链中占据重要位置。将分散的菇农纳入供应链的垂直协作中,整合供应模式,提高食用菌供应链的运作效率是产业发展丞待解决的现实问题。本文从供应链的角度出发,以交易成本、农户行为、供应链管理、垂直协作等理论为依据,采用问卷调查、Mutinomial Logit回归分析、二元Logit回归分析等方法,选取河北、辽宁、吉林、黑龙江、江苏、浙江、福建、山东、河南、湖北10个省份中的447位菇农为样本,对菇农垂直协作方式选择和参与行为进行了系统的分析。研究结果表明：(1)大部分菇农仍然选择通过食用菌商贩进行销售,而进行协作销售的较少；(2)影响菇农选择协作方式的主要因素是生产经营特征和交易特征,包括销售难易、省内市场了解度、销售价格的公平度、货款结算方式、食用菌运输困难度；(3)菇农参与协作的意愿是很强烈的,影响菇农参与供应链垂直协作的因素主要包括个人特征、家庭特征、生产经营特征、交易特征等因素；(4)参与供应链垂直协作能够提高菇农的收入。在此基础上,本文提出如下对策建议：(1)加快建立食用菌产品的标准化和质量分级制度；(2)加大食用菌供应链建设的投入力度；(3)建立高效的食用菌价格收集和传播体系；(4)提高菇农的组织化程度；(5)加大新型供应链垂直协作方式的宣传。