近年来中国不断加大科技创新投入,但我国创新能力仍然较弱,在此情况下,创新效率的提升显得尤为重要。在技术水平一定的情况下,创新资源从效率低的企业和部门流向效率高的企业和部门,会提高整体层面的创新效率,相反则会造成效率损失。要研究如何优化创新资源配置,首先应该回答当前创新资源的错配程度如何以及造成了多少效率损失。已有研究缺少从创新资源错配的角度对于创新效率损失的考量,因此本文从创新资源的错配这一视角出发,着重考察作为创新活动主体的工业行业资源错配情况以及带来的创新效率损失。本文基于资源配置和知识生产函数理论,借鉴HK模型框架,构建了行业创新资源错配程度和效率损失测算模型,利用2015-2018年中国工业A股上市公司研发数据对不同工业行业内企业的创新资源错配程度指数,以及资源错配带来的行业层面和工业总体创新效率损失进行测算和分析,并将总体创新效率损失进行进一步分解。主要得到以下结论:(1)尽管程度不同,但不同工业行业内企业普遍存在程度较为严重的创新资源错配情况,创新资源在配置时出现明显的“顾此失彼”,其中尤以资源配置过剩的状况突出,这表明创新资源在中国不同工业行业内企业间的流通阻力较大,难以实现创新资源的有效配置。(2)中国不同工业行业内创新资源错配为部分工业行业带来超过60%的创新效率损失,但部分行业创新效率损失呈现逐年下降的趋势,工业行业内部的创新效率损失整体呈现改善的趋势,若能改善工业行业内企业之间的资源配置状况,大多数工业行业的创新效率将取得较大的提升。(3)中国工业行业创新资源错配为工业总体带来了29.13%到39.90%的创新效率损失,其中工业行业间资源错配对于效率损失的贡献逐年增加。如果中国工业行业创新资源得到有效配置,中国工业创新效率将在现有基础上提升0.411到0.663倍。最后基于以上研究结论,本文分别从政府,行业和企业三个方面提出具体可操作的政策建议,为我国工业行业改善创新资源配置,提高创新效率提供助力。