脆性X智力低下蛋白Asp-132位点在其入核过程中的作用及机制

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【目的】  脆性X综合征(FXS)是一种常见的遗传性智力障碍疾病,脆性X智力低下基因(FMR1)5'末端非编码区 CGG三核苷酸重复数异常及其相邻部位 CpG岛异常甲基化使FMR1编码蛋白 FMRP的缺失是导致该病的主要原因,也有少部分因FMR1基因部分缺失或点突变而致病。FMRP作为一种选择性RNA结合蛋白及翻译调控因子具有调节脑发育和神经元突触可塑性作用,其主要在胞浆中表达,仍有小部分在核内参与DNA修复,micRNA转录后修饰、成熟mRNA的出核转运等重要功能。通常大分子蛋白质进入细胞核发挥功能,需要核输入受体在胞质内识别底物的NLS从而介导入核,有研究已经证实FMRP115—150位氨基酸片段为FMRP的核定位信号区,对FMRP的入核有重要作用,但目前国内外对FMRP具体的入核机制尚不清楚。PABP1是一种mRNA结合蛋白,与FMRP有着非常相似的生物学功能,同样具有核质穿梭功能,参与 mRNA的成熟、翻译、转运等多种功能,有研究证实FMRP与PABP1能共定位在mRNP复合物中。表明 PABP1可能协助了 FMRP入核转运的过程。最近有研究发现 FMR1基因CGG重复拷贝数正常但NLS结构域错义点突变同样能导致FXS。因此对FMRP NLS的结构域及其入核机制的研究将有助于更深入了解 FMRP的功能。综上,本研究拟通过比对物种间FMRP NLS的氨基酸序列,找出人源FMRP NLS可能的关键氨基酸,构建其突变质粒,在培养细胞中分析其对 FMRP入核的影响,以期进一步在体外实验中探索FMRP的入核途径,为研究FXS的发病机理及基因筛查提供新的依据。  【方法】  1.采用VectorNTI软件比对人和其它14种物种(包括黑猩猩,猩猩,恒河猴,猪,狗,猫,鲸,兔,豚鼠,小鼠,大鼠,鸭嘴兽,鸡和绿头鸭)间FMRP核定位信号区111-152位氨基酸序列,分析其保守性。  2.运用生物信息学网站 http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do和http://swissmodel.expasy.org/workspace,为人源性野生型FMRP及人和小鼠间NLS区两个非保守位点分别互换的突变型FMRP(D132E、A145S)建立同源模型,预测比对蛋白空间二级结构。  3.采用巢式PCR技术,构建表达融合V5标签的野生型人源FMRP的真核表达载体 pCMV-V5-FMRP-WT,并以此为模板,采用定点诱变技术,构建突变型真核表达载体 pCMV-V5-FMRP-D132E,pCMV-V5-FMRP-A145S,均筛选鉴定阳性重组质粒并测序验证。  4.将野生型pCMV-V5-FMRP-WT及突变型质粒pCMV-V5-FMRP-D132E、pCMV-V5-FMRP-A145S分别转染入人源性HEK293及 NT2细胞,48h后分别提取浆核蛋白,采用Western blot检测并比较野生型与突变体转染细胞中FMRP在细胞核中的分布比值(细胞核/细胞质)的差异。  5.应用间接免疫荧光法,在共聚焦显微镜下观察野生型FMRP与突变体在HEK293细胞中的亚细胞中定位,并应用ImageJ软件比较FMRP在细胞核中的分布比值核/质荧光值的变化。  6.转染野生型pCMV-V5-FMRP-WT及突变 pCMV-V5-FMRP-D132E质粒后的HEK293细胞,48h后应用免疫共沉淀(Co-IP)技术及SDS-PAGE电泳,分离切取与野生型与突变型组结合有差异的条带,LC/MS/MS分析差异结合蛋白,利用Western blot鉴定。  7.利用野生型和突变体差异结合的蛋白的干扰表达质粒(以及相应对照质粒)转染HEK293细胞,转染48小时之后提取细胞浆核蛋白,采用Western blot在蛋白水平上检测对照组和干扰组的内源性FMRP在浆核中的分布。  8.将干扰表达质粒,以及相应对照质粒转染HEK293细胞,48h后采用RNA免疫共沉淀技术(RIP)分离与内源性FMRP结合的RNA,采用qRT-PCR检测3个候选的FMRP靶基因(DLG4, MAP1B and FMR1)mRNAs与FMRP的结合情况。  【结果】  1、各物种间FMRP核定位信号区111-152氨基酸序列,除了132、145位氨基酸不同其余部分保守,132位天冬氨酸(D)出现在人类和其它高等动物中,而132位谷氨酸(E)只出现在小鼠等其它低等动物中;145位丙氨酸(A)只出现在人类,145位丝氨酸(S)则出现在其它物种中。另NCBI网站上查得人FMRP145位氨基酸残基为多态性位点,在正常人群中都含有丙氨酸(A)、丝氨酸(S),。上述结果提示132位氨基酸残基可能为FMRP进化相关的功能位点。  2、空间二级结构预测显示, D132E的二级结构发生改变,而A145S未出现变化,结果提示D132E空间二级结构的改变可能影响FMRP的功能。  3、与过表达野生型人源 FMRP(D132)细胞相比,突变体 A145S细胞中FMRP的分布比值(细胞核/细胞质)无显著性差异;而突变体D132E细胞中FMRP的分布比值显著降低(约为野生型组的0.1),差别有统计学意义;进一步采用免疫荧光技术验证,突变体 D132E较野生型 FMRP(D132)在细胞核中的分布明显降低(约为野生型组的18%),差别有统计学意义。表明人FMRP132位天冬氨酸对FMRP的入核起到重要作用。  4、CO-IP实验联合质谱分析发现,野生型FMRP可结合PABP1,而突变体D132E未见结合。进一步行CO-IP联合Western blot实验,结果发现D132E结合PABP1的能力显著降低(约为野生型 FMRP结合能力的0.1)。上述结果表明FMRP与PABP1能直接结合,而FMRP突变体D132E降低了该结合能力。  5、在HEK293细胞中干扰PABP1表达的结果显示,干扰表达PABP1后内源性FMRP在细胞核中的分布比值较对照组明显降低(为对照组的0.1倍),差别有统计学意义。该结果表明了PABP1参与了FMRP的细胞核定位。  6、RIP实验显示,干扰PABP1的表达后,FMRP结合靶基因(DLG4,MAP1B, FMR1)mRNA的能力较对照组发生改变,其中结合DLG4 mRNA的量较对照组减少(约0.5),结合MAP1B mRNA的量较对照组明显增多(约2倍),结合FMR1 mRNA的量无差异。该结果提示PABP1能选择性的改变FMRP结合靶基因mRNA的能力。  【结论】  本研究发现了人源FMRP核定位信号区132位天冬氨酸(D)作为一个物种进化相关的功能位点,对FMRP的细胞核定位有重要作用;首次证实了PABP1作为一种FMRP的结合蛋白参与了FMRP的核定位;并进一步证实了PABP1可选择性的调节FMRP靶mRNA的出核转运。为深入研究FMRP的功能和点突变致病的机制提供了新的依据。
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