农民专业合作社是在农村家庭联产承包责任制的基础上,由同类农产品的生产者或为农业生产经营服务的提供者、消费者,自愿组合、民主管理的互助性经济联合体。体现出经济社会发展促进了社会分工；聚小农分散作业为专业经营而形成规模优势,在市场经济条件下,增强农民市场竞争能力,促进农业先进科技推广,实现规模经营效益。为实现“生产发展、生活宽裕、乡风文明、村容整洁、管理民主”推进社会主义新农村建设目标,构建农村和谐社会,最为现实的途径是发展农民专业合作。通过对几种新农村农民专业合作社运行模式的调研,和对辽宁省朝阳市新农村农民专业合作社的案例分析,以及全省各级示范基地专业合作社的调查问卷,说明辽宁省的农民专业合作社的发展,存在着相对数量少、规模小,发展不平衡；合作社内部运作不规范；政府对合作社扶持力度不够,影响新农村建设进程；思想认识不到位,外部环境不完善等问题。借此提出政府应支持农民自主建立专业合作社；抓典型示范及支持龙头企业和农产品行业协会；健全农民合作社的组织机构,完善内部管理机制；完善其利益分配机制及其监督约束机制等完善农民专业合作社运行模式的对策和建议。