【摘 要】
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研究背景和目的:慢性髓系细胞血病(chronic myelogenous leukemia,CML)是一种来源于多能造血干细胞的克隆增殖性疾病,主要由t(9;22)(q34;q11)易位产生典型的BCR-ABL1融合基因,该基因具有高度酪氨酸激酶活性,使肿瘤细胞异常增殖和凋亡受阻。伊马替尼(Imatinib Mesylate,IM)等酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibit
【基金项目】
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国家自然科学基金资助项目(20151075506); 广州市科技计划项目(201904010488); 北京希思科-石药肿瘤研究基金:miR-203影响伊马替尼治疗慢性粒细胞性白血病的敏感性与耐药性及分子机制的研究(Y-sy2018-109);
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研究背景和目的:慢性髓系细胞血病(chronic myelogenous leukemia,CML)是一种来源于多能造血干细胞的克隆增殖性疾病,主要由t(9;22)(q34;q11)易位产生典型的BCR-ABL1融合基因,该基因具有高度酪氨酸激酶活性,使肿瘤细胞异常增殖和凋亡受阻。伊马替尼(Imatinib Mesylate,IM)等酪氨酸激酶抑制剂(tyrosine kinase inhibitors,TKI)的广泛应用,极大程度改善了 CML患者的长期生存。但仍有一部分患者在治疗过程中出现伊马替尼耐药,导致治疗失败。近期研究证实,环状RNA(circular RNAs,circRNAs)可能通过调控癌基因的表达介导CML对伊马替尼耐药。本研究通过高通量测序技术筛选伊马替尼敏感与耐药组中差异表达的circRNAs表达谱并探索circMTOR在CML耐药中的具体分子调控机制。研究方法:本研究共收集了 5例对伊马替尼敏感CML患者和5例无ABL激酶区突变的伊马替尼耐药CML患者外周血标本,通过分离外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMCs)进行RNA-seq鉴定,分析两组差异表达的circRNA 表达谱,并采用实时荧光定量 PCR(quantitative real-time-PCR,qRT-PCR)进行验证。通过对测序数据进行深入的生物信息学分析,包括circRNA-miRNA网络、Gene Ontology(GO)和 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路分析,选择在伊马替尼耐药患者和耐药细胞系中均显著性高表达的部分circMTOR进行功能验证。应用双荧光素酶报告基因系统来确认circMTOR和预测的miRNA之间的靶标关系,然后通过siRNA干扰技术、qRT-PCR、MTT实验及流式细胞学分析等实验方法,在CML细胞系中进行分子功能研究及其凋亡通路的分子验证。研究结果:RNA-seq分析显示,与伊马替尼敏感的CML患者相比,在伊马替尼耐药的CML患者中有1852个circRNA差异表达(上调800个,下调1052个)。qRT-PCR 结果显示,hsacirc0110442(circMTOR)在 CML 耐药患者的 PBMC 和K562R细胞中表达水平上调最为显著。hsacirc0110442来源于mTOR基因的Exon20和Exon23,本研究中称为circMTOR。我们通过生物信息学构建了circMTOR介导的竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络,GO分析表明circMTOR参与多种生物学过程;根据KEGG分析显示,circMTOR可能与PD-L1/ErbB及VEGF等肿瘤相关的通路有关,通过进一步分析发现,circMTOR存在miR-34a结合位点,而c-Myc可能是miR-34a的靶基因。通过siRNA沉默circMTOR,miR-34a表达上调,引起c-Myc基因表达下调,K562R细胞凋亡率增加,对伊马替尼敏感性增强。结论:1)利用高通量测序技术,在CML伊马替尼耐药和敏感组患者PBMC细胞中筛选到差异表达circRNAs,生物信息分析显示circRNA可能参与多种信号通路调控的CML伊马替尼耐药机制;2)qRT-PCR 验证到hsacirc0110442(circMTOR)在 K562R 组中上调最显著;siRNA敲低circMTOR可显著抑制K562R细胞株的增殖,并诱导细胞凋亡,增强CML细胞对伊马替尼的敏感性;3)双荧光素酶报告基因和功能挽救实验表明circMTOR通过与miR-34a结合发挥ceRNA功能,调控K562R细胞对伊马替尼敏感性;4)Western Blot试验表明,miR-34a通过调控靶基因c-Myc的表达,影响K562R细胞的增殖和凋亡。5)异常活化的circRNAmTOR/miR-34a/c-Myc轴可能为非BCR-ABL1依赖性的伊马替尼耐药机制之一。
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