随着1997年在日本签订的《京都议定书》和2009年在丹麦举行的哥本哈根会议，二氧化碳的排放引起全球气候变暖导致的一系列气候问题被逐渐重视，森林对二氧化碳的汇聚作用在国内外逐渐被认可，针对森林碳汇功能的研究也逐渐增多，但目前来看，针对广域性的森林碳汇研究较多，针对区域性的研究则较少，特别是针对我国西南地区喀斯特地貌森林碳汇功能的研究少之又少。　　本文以麻江县和雷山县为研究区，探讨了不同土壤（喀斯特与非喀斯特）、不同龄组、不同立地条件（土壤厚度）天然马尾松林生态系统碳储量空间分布特征和分配规律，进而对比分析贵州省喀斯特与非喀斯特区域天然马尾松林碳储量时空分布差异及其影响因子，为当地森林资源因地制宜、合理应用、分区管理提供依据。　　1.喀斯特区域和非喀斯特区域天然马尾松林土壤层碳储量随着龄组的变化而逐步增加，不同龄组同一土层深度的土壤碳储量也逐步增加，但相同龄组的土层，由于深度不同程度的增加，碳储量在总体趋势上则相应减少；喀斯特区域土壤层碳储量增长率先抑后扬，非喀斯特区域土壤层碳储量增长率先下降后持平。　　2.喀斯特区域和非喀斯特区域天然马尾松林乔木层碳储量由于龄组的变化而逐步上升，但喀斯特区域乔木层碳储量增长率先扬后抑，非喀斯特区域乔木层碳储量增长率持续下降。　　3.喀斯特区域和非喀斯特区域天然马尾松林灌木层碳储量随着龄组的变化逐步增加，草本层碳储量随着龄组的变化并没有表现出较大差异，凋落物层碳储量由于龄组的变化逐步上升。　　4.喀斯特区域和非喀斯特区域乔木层和土壤层碳储量之和均占整个生态系统总碳储量的绝大部分，但灌木层、草本层以及凋落物层碳储量之和占整个生态系统总碳储量比例都很小。因此，从幼龄林到成熟林碳储量的增长率主要是由于土壤层和乔木层碳储量的增长导致。　　5.喀斯特区域和非喀斯特区域天然马尾松林碳储量分布差异明显，从幼龄林到成熟林，非喀斯特区域碳储量增长趋势较明显，碳储量明显高于各对应龄组的喀斯特区域，并呈现出两区域差距随着龄组的变化而逐渐加大的趋势。　　6.喀斯特区域和非喀斯特区域在乔木层地上、乔木层根系、土壤层三个层次碳储量差异较大，且喀斯特区域均明显低于非喀斯特区域。但灌木层地上、灌木层根系、草本层地上、草本层根系及凋落物层碳储量无明显差异。