胶质瘤组织中ADAR2剪接异构体的表达鉴定及其介导GluA2亚基Q/R位点的RNA编辑

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目的:在胶质瘤组织中检测Glu A2亚基Q/R位点的RNA编辑水平,鉴定ADAR2的选择性剪接位点及剪接异构体的表达特征。初步探讨胶质瘤组织中Q/R位点的RNA编辑、ADAR2及其剪接异构体的表达与胶质瘤复发、瘤周水肿及RNA编辑复苏之间的联系。方法:随机调取2011年至2015年间30例胶质瘤手术切除后冻存标本及3例脑外伤切除的内减压脑白质标本。提取总RNA,RT-PCR产物测序,检测Glu A2亚基Q/R位点的RNA编辑水平;分区段扩增ADAR2全长c DNA,鉴定其选择性剪接位点。根据鉴定出的选择性剪接位点,设计引物,进行Real time PCR,扩增ADAR2及其剪接异构体,分析其表达特征。根据收集的临床资料及测序结果,分析在Q/R位点的RNA编辑、ADAR2及其异构体的表达与特定分子生物学事件及临床特征的联系。结果:在初发高级别胶质瘤中Glu A2亚基Q/R位点的RNA编辑水平较脑白质对照组显著下降,但ADAR2的相对表达量在脑白质对照组及各胶质瘤组间并无显著差异。RTPCR产物电泳后测序,在胶质瘤组织中共检测到ADAR2m RNA的三个选择性剪接位点:外显子-1与外显子1之间发生的选择性剪接,导致外显子1a的插入;外显子2的删失;外显子5a的插入。Real time PCR结果显示胶质瘤组织中ASV(1a+)/ASV(1a-)、ASV(2-)/ASV(2+)及ASV(5a+)/ASV(5a-)的比值与脑白质对照组并无显著性差异,但在胶质瘤组中,有56%的样本发生了ASV(5a+)/ASV(5a-)比值的上调。在复发胶质瘤与初发胶质瘤对比,Glu A2亚基Q/R位点的RNA编辑水平明显未见明显差异,ADAR2相对表达量及各组异构体之间的比值并无显著差异。胶质瘤中RNA编辑活性复苏组,ADAR2表达量显著增高,但其剪接异构体的相对表达量并无明显差异。在不同的瘤周水肿程度分级中,重度水肿组样本Q/R位点的RNA编辑水平较轻度水肿及无明显水肿显著降低(P<0.05);Spearman相关分析提示瘤周水肿分级与胶质瘤中Glu A2亚基Q/R位点的RNA编辑水平以及ADAR2的相关系数为-0.679和-0.429。不同瘤周水肿分级样本间ADAR2的相对表达量及同一剪接位点剪接异构体之间的比值并无显著差异。结论:WHO III-IV级初发胶质瘤中,Glu A2亚基Q/R位点的编辑水平明显下降。Q/R位点的编辑水平及ADAR2的相对表达量与胶质瘤瘤周水肿程度呈负相关关系。在胶质瘤组织中检测到ADAR2 m RNA的3个选择性剪接位点。胶质瘤组织中Glu A2亚基Q/R位点RNA编辑的复苏,伴随着ADAR2的表达的上调。
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