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本论文针对基于CMOS图像传感器的显微图像系统，详细论述了CMOS图像传感器的原理、构造及当前的发展状况，阐述了各种显微图像处理系统的构成和特点，并着重针对基于CMOS图像传感器的显微图像系统的软件处理问题研究了程序结构和编程方法，就如何使用基于VFW的视频捕捉，基于MCI的视频播放，基于DIB的图像操作等给出了应用结果。本文还针对常规图像处理方法在CMOS图像传感器的显微图像系统中的应用提出了见解。 本论文给出了基于CMOS图像传感器的自行编制的显微图像处理软件的应用结果，并针对目前CMOS图像传感器所存在的一些局限性，提出了在显微图像处理工作中的改进意见和前景展望。