肿瘤特异性生物标志物的挖掘是肿瘤发生、发展机制研究以及肿瘤防治的重要基础。主要的肿瘤生物标志物包括核酸、蛋白质、代谢物等。肿瘤类型多样,且存在组织特异性和肿瘤异质性的各种差异,对于不同类型肿瘤的分子特征进行深入挖掘,有助于为肿瘤调控机制研究和防治提供理论支持。我们前期研究发现WNT信号通路与多种恶性肿瘤的发生发展有关,本研究尝试以WNT信号通路与肿瘤的关系为切入点,借助多种手段探索WNT信号通路各组分是否具有肿瘤特异性的表达模式。并基于此,初步探讨其是否可作为肿瘤标志物对特定肿瘤进行表征。我们首先对TCGA数据库（The Cancer Genome Atlas）肿瘤测序数据和GTEx（Genotype-Tissue Expression）数据库人体正常组织测序数据进行联合分析,发现WNT信号通路的配体和受体/共受体在不同类型肿瘤中存在特定的表达模式。相对于正常组织,WNT通路各配体中,WNT3 m RNA和WNT4 m RNA在黑色素瘤中表达降低;WNT3 m RNA在慢性淋巴细胞性白血病中显著上升;而WNT5A m RNA和WNT7B m RNA则在多种上皮鳞状细胞癌中表达上调。WNT通路受体或共受体中,相对于正常组织,SDC3 m RNA在黑色素瘤和脑胶质瘤中特异性表达上调;LRP5 m RNA则在多种腺瘤中上调;而在多种上皮鳞状细胞癌中,则表现出GPC1m RNA、FZD6 m RNA、FZD7 m RNA和PTK7 m RNA的同步上调。随后,主要以肺鳞状细胞癌为研究对象,我们借助免疫组化实验方法,对临床患者肿瘤组织芯片中WNT5A、WNT7B、GPC1和FZD7几种蛋白的表达进行了检测。结果表明:相对于癌旁正常组织,WNT5A、WNT7B两种配体和GPC1、FZD7两种受体/共受体在肺鳞状细胞癌中表达均显著升高。此外,考虑到该通路的分泌性蛋白有可能以外泌体的形式存在,我们借助肺鳞状细胞癌细胞系,对其外泌体与WNT分子的关系进行了初步研究。结果表明,肺鳞状细胞癌细胞系NCI-H226和SK-MES-1中存在WNT7B、GPC1、SDC1和FZD7的表达,且两种细胞的外泌体中也存在高丰度的GPC1蛋白,提示GPC1可能是潜在的肺鳞癌循环肿瘤标志物。由于测序数据和临床样本验证都表明WNT7B和WNT5A在上皮鳞状细胞癌中表达上调,我们随后借助生物信息学分析方法,尝试从转录调控的角度来探讨可能的共表达调控机制。借助ALGGEN（http://alggen.lsi.upc.es/）和Cistrome Data Browser（http://cistrome.org/db/）两种不同的分析策略,我们预测到WNT7B和WNT5A存在数种共调控的转录因子;随后,对这些预测的转录因子在TCGA数据库肺鳞状细胞癌患者肿瘤样本中的表达进行了分析,发现MYC、RAD21、H2AZ2、H2AZ1、NFE2L2均在肺鳞癌有明显高表达;而POLR2A、NFE2L2和YAP1三个转录因子与WNT5A和WNT7B表达呈现出较好的相关性。此外,为开发更多、更精准的多参数肿瘤标志物筛选体系,我们依托TCGA测序数据,引入t-随机邻近嵌入（t-distributed Stochastic Neighbor Embedding,t-SNE）降维和可视化的分析方法,对挖掘多维度、特异性的肿瘤标志物谱开展了初步探索。