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雄性激素受体(AR)在男性表型的发展和包括前列腺癌在内的不同的人类疾病中起着重要的作用。依赖于细胞类型,AR既可以作为促进剂又可以作为肿瘤的抑制剂。AR促进型反应过程已经研究得很透彻,然而它的抑制型反应过程还没有详细的研究过。以前的研究表明PC3细胞表达野生型的AR抑制生长和抑制入侵。我们在不同的生长条件下(例如,在有或无雄性激素受体和在不同的雄性激素受体的浓度下)应用表达谱用于发现表达AR (PC3-AR)的PC3细胞的反应过程,然后应用新开发的ChIP-Seq技术用于识别PC3癌基因组的AR结合区域。通过比较模拟转染的PC3细胞和AR转染的细胞,我们惊奇地发现了3,452个差异表达的基因,即使是在没有添加雄性激素受体(例如,在ethanol control中)的情况下。应用ChIP-Seq分析,在PC3细胞的癌基因组中发现了6,629AR结合区域,FDR(假阳性率)小于0.05.大约22.4%可以匹配到距离转录起始位点2kb的区域。我们在PC3-AR细胞的AR结合位点中发现了三个新的AR结合模体,其中两个共享一个核心一致序列CGAGCTCTTC,一共匹配到27.3%的AR结合位点(1,808/6,629)。相反,仅仅2.9%(190/6,629)的AR结合位点包含标准的Transfac数据库的AR矩阵M00481、M00447和M00962,它们大部分来源于雄性激素受体依赖型的AR促进型反应基因。除此之外,在AR结合区域我们发现4个排位靠前的共转录因子,包括TEF1(转录增强因子)、GATA(GATA转录因子)、OCT(八聚物转录因子)和PU1(PUI转录因子)。在前列腺癌细胞中,我们的数据为理解AR的生长抑制反应过程的分子机制提供了有用的数据,可以用于开发新的前列腺癌的治疗策略。