本文以辣椒(capsicum annuum．L)的两个品种(“海丰12号”和“茄门甜椒”)为材料，利用KB培养基和芽胞杆菌培养基从辣椒的叶内、根面及根内，共分离到364株内生细菌和根面细菌；并对辣椒两个品种的根内和叶内的内生细菌的数量情况进行了比较分析；对相关的植物病害的防治作用进行了初步研究；对筛选出的部分菌株进行了初步分子鉴定。 在同一品种的辣椒中利用同样的培养基筛选根内细菌的数量多于叶内细菌的数量；分离自“海丰12号”的内生细菌中，有较多菌株具有拮抗病原菌活性。 对这364株细菌进行室内体外拮抗试验，所用的病原菌共15株，包括：辣椒疫霉病原菌(Phytophthora capsici Leonian)、番茄灰霉病原菌(Botrytis cinerea Pers．ex Fr．)、稻瘟病原菌(Pyricularia grisea(Cooke)Sacc．)、黄瓜疫霉病原菌(Phytophthora melonis Katsura)、棉花黄萎病原菌(Verticillium albo-atrum Reinke et Berthold．)、辣椒炭疽病原菌(Colletotrichum capsici(Sydow)Butler and Bisby)、黄瓜枯萎病原菌(Fusarium oxysporium(Schl．)f．sp．cucumerinum Qwen)、黄瓜黑星病原菌(Cladosporium cucumerinum Ellis et Arthur)、棉疫霉果腐病原菌(Phytophthora parasitica Destur)、棉花枯萎病原菌(Fusarium oxysporum．f．sp．vasinfectum)、立枯病原菌(Rhizoctonia solani)、玉米大斑病原菌(Helminthosporium turcicum Passerini)、烟草赤星病原菌(Alternaria longipes(Ellis et Everhart))、，剑麻炭疽病原菌(Colletotrichum agaves Cavara)、小麦根腐病原菌(Cochliobolus sativus(Ito & Kurib) Drechsler ex Daster)，共筛选到20株具有较好拮抗活性的细菌，拮抗作用最强的菌株GF8其平板抑菌圈半径达11mm。 对拮抗效果较好的细菌进行温室接种试验，结果表明：黄瓜苗和辣椒苗经过菌剂处理后能够在一定程度上减轻某些病害的发生。根面细菌GF8对黄瓜黑星病、辣椒疫病和辣椒立枯病都有较好的防病效果，其防病效果分别为45.35％、28.42％和50％。 提取上述20种细菌的基因组DNA，利用地高辛标记的固氮酶基因nifHDK的探针与细菌基因组DNA分子之间进行杂交，然后显色以检测是否具有固氮酶nif基因。结果发现，20种细菌中均未检测到固氮酶nif基因。 采用16S rRNA的保守序列作为通用引物(27f、1541r)对接抗细菌的基因组进行PCR扩增，将回收纯化的PCR产物测序并将序列进行分析，结果发现，除了菌株GF8、YL35外，其余的菌株与Genebank中已知菌中的同源性均超过或等于98％，而且多数菌株与数据库中已知菌具有大于99％的相似性。因此，所测定的14株细菌中，有13株菌可确定到属，其中Kr6、Yr28、Kr31属于洋葱伯克霍氏菌属(Burkholderia cepacia)，GF8、YL10、Kr22属于铜绿假单胞菌属(Pseudomonas aeruginosa)，Kr7、Kr14、Yr33、Yr37属于假单胞菌属(Pseudomonas)，YL14属于细菌属(Bacterium)，Kr28属于伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia)，KL1属于短杆菌属(Brevibacillus reuszeri)。菌株YL35与数据库中所有序列的最大同源性为93％，其菌属的确定有赖于形态的分析及其它分子方法的鉴定。 本项研究获得了一批具有研究和应用潜力的辣椒内生和根面细菌菌种资源。