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遗传图谱的构建及整合仍然是植物基因组学研究的重要内容。遗传连锁图谱广泛应用在植物的标记辅助选择育种到功能基因图位克隆等方面。大豆（Glycine max）是重要的经济作物，但由于其为古源四倍体和严格自花授粉，基因组含有广泛的复制区和丰富的重复序列，使得其遗传图谱研究落后其他作物。近年来新开发的SSR标记对来自不同群体的遗传图谱的整合起着关键作用。 本研究共有三个作图群体，RIL作图群体是重组自交系Jinf群体（晋豆23×ZDD2315），这个包含118个单粒传代（SSD）的RIL株系；F2作图群体是编号分别为03172和编号为03197。其中编号03172 F2群体来自哈交96-9和ZYD677的杂交，编号03197的F2群体来自黑农33和ZDD2315的杂交组合。这些杂交亲本在特定的性状方面有大的差异，在完成图谱整合构建的同时，今后还可以对若干重要的农艺性状进行QTL定位。 选用513对SSR引物对03172群体进行多态性筛选，共有213对引物有明显多态性，多态率为41.5％；选用531对SSR引物对03197群体进行多态性筛选，共有231对引物有多态性，多态率为43.5％。从SSR引物扩增的多态性来看，在03172和03197群体中SSR引物的扩增多态性基本与Jinf群体中的44.1％的多态性相差不大。由此可见SSR在大豆中的多态性远高于其他标记如ISSR、AFLP、RFLP和RAPD的一般不到30％的多态性。在95个株系的F2群体03172中，共选有132对SSR引物对其进行基因型分析，其中母本基因型占27.8％，父本基因型占26.7％，杂合基因型为45.5％；在180个株系的F2群体03197中，共选用A2和G上的26个SSR引物进行基因型分析，母本基因型为24.1％，父本基因型为21％，杂合基因型为54.8％；两个F2组合群体均符合1:2:1的孟德尔的理论分离比率，说明两个F2群体有正常的遗传结构，可以用于遗传作图分析。 本研究是基于“锚定SSR标记”作图策略，利用2个F2群体，选用592对SSR引物，对宛煜嵩等利用重组自交系群体Jinf构建的含有