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【背景】幽门螺杆菌（Helicobacter pylori，H. pylori）是消化性溃疡的最常见也是可治愈的病因，目前共识指南强烈推荐检测并治疗消化性溃疡患者的H. pylori感染。质子泵抑制剂+克拉霉素+阿莫西林的标准三联根除H. pylori疗法在世界范围内广泛应用，但是根除H. pylori疗法可能有很多不良反应并影响肠道菌群进而影响人类健康。而适当添加益生菌制剂则可能减少不良反应及肠道菌群紊乱的发生。【目的】在标准三联疗法基础上辅助应用枯草杆菌、屎肠球菌二联活菌肠溶胶囊，初步探讨益生菌制剂降低三联疗法不良反应的疗效；探讨标准三联疗法及联合应用益生菌疗法在根除H.pylori治疗前及治疗后肠道菌群多样性的变化，研究益生菌是否能够改善肠道菌群。【方法】自2012年10月至2013年11月共纳入40例存在H.pylori感染且无并发症的活动期DU患者，随机分为标准三联治疗组（Triple treatment，TT）和标准三联加益生菌治疗组（Triple treatment+probiotic，TP），并纳入20例正常健康人作为空白对照组（Health control，HC）。TT组口服2周埃索美拉唑（20mg，bid）、克拉霉素（0.5g，bid）和阿莫西林（1g，bid）；TP组口服2周埃索美拉唑（20mg，bid）、克拉霉素（0.5g，bid）和阿莫西林（1g，bid），同时口服6周枯草杆菌屎肠球菌二联活菌胶囊（0.5g，tid）。记录患者治疗前、中、后的临床症状及不良反应情况，在治疗后4周复查胃镜及13C-呼气实验。于治疗前（第0周）、治疗结束时（第2周）、治疗后4周（第6周）和8周（第10周）留取大便标本并提取细菌DNA，利用PCR方法提取16S rDNA V4区序列，通过Illumina Miseq高通量测序平台测序分析肠道菌群多样性变化。【结果】DU在中青年男性中高发，DU时胃液pH值（0.72）较正常人（1.27）明显降低，行抗H.pylori治疗后胃液pH均能恢复正常。TT组和TP组的溃疡愈合率（90%vs100%）和H.pylori根除率（80%vs85%）无差异。TT组不良反应发生率高于TP组（35%vs20%，P＜0.05），主要症状是腹泻、恶心、腹痛、味觉障碍、腹胀、纳差和便秘，多数发生在治疗期间，85.7%为轻中度，所有患者均可耐受治疗。TP组能够显著改善临床症状、提高治疗耐受性并降低不良反应发生率，尤其是腹泻的发生率较TT组明显下降。16S rDNA测序分析发现HC组平均OTUs为875，TT组平均为635，TP组平均为725。在门水平上，TT组占总数0.1%以上的共注释到10个门，TP组为9个门；在属水平上，TT组占总数1%以上的共有10个属，TP组共有12个属。尽管菌群所占比例不同，两组的优势菌门相同，都是Bacteroidetes、Firmicutes和Proteobacteria，占据总菌量的96%。两种治疗方法的优势菌属不全相同，比例全不同。TT组前5位是Bacteroide（s30.3%）、Escherichia（14.9%）、Prevotella（10.7%）、Faecalibacterium（6.0%）、Parabacteroides（2.6%）；TP组前5位是Bacteroides（27.1%）、Escherichia（10.0%）、Faecalibacterium（6.8%）、Prevotella（5.2%）、Phascolarctobacterium（3.7%）。抗H.pylori治疗2周可以导致肠道菌群多样性降低，尤其是Firmicutes；停药4周时两组均有恢复至治疗前水平的趋势；停药8周时TT组未再变化，而TP组继续恢复至接近于正常人水平。【结论】TP疗法能够降低TT疗法的不良反应发生率。DU时患者肠道菌群多样性降低，抗H.pylori治疗导致菌群多样性继续下降，停药4周时肠道菌群有恢复趋势，且TP组恢复肠道菌群结构方面优于TT组。