随着经济的发展,科学技术已成为发展一国经济、提升国际竞争力和综合国力最重要的因素之一。近年来我国加大对科技活动的重视,增加科技投入,提高科技投入的效率,使科学技术是第一生产力的作用充分发挥。而一国的科技实力的提升只有以效率的提高为前提才能具有竞争力和可持续性。因此,对科技投入产出进行绩效研究,对于资源的合理利用,提高资金的使用效率具有十分重要的现实意义。本文以现代经济理论、现代统计理论和方法为指导,综合运用科技统计学、运筹学、数理统计学、计量经济学和绩效管理学等有关理论与方法,对我国科技投入绩效进行研究。首先,本文从科技投入及绩效的相关概念入手,分析我国科技投入的现状、R&D经费支出特征及国际比较;其次根据科技活动的性质和特点,提出了针对我国科技投入绩效研究的评价体系,并构建了我国科技投入绩效研究的指标体系,采用由因子分析和数据包络分析相结合的二次绩效评价模型进行评价;最后,在以上研究的基础上,纵向分析我国1998-2008年科技投入产出绩效情况,以及横向分析我国31个省市自治区科技投入产出绩效情况,根据实证分析结果,提出提高我国科技投入产出绩效的政策建议。