近年来,对Bose-Einstein凝聚系统中混沌的Josephson效应的研究引起了广泛的关注.Bose-Einstein凝聚系统中内在的非线性以及与外场相互作用,使其成为一个典型的混沌系统.已有的解析方法虽能对系统混沌起始作出一些预测,却不能解决混沌系统中的求解问题.最近发现,通过直接微扰法可以得到一类微扰作用下的混沌系统的形式解.该文正是在这一基础上展开的.该文共包括五个部分:绪论部分简单介绍了关于Bose-Einstein凝聚系统中的正常的和混沌的Josephson效应的研究历史和现状,该文的基本思路和方法.基于Smerzi等人的工作,在第二章主要讨论了对称不含时势阱情况下系统的π位相振荡和宏观量子自囚.第三章研究了Bose-Einstein凝聚系统与激光相互作用下的混沌的Josephson效应.运用直接微扰法,我们给出了一级微扰方程的解析解及其有界性条件.理论分析表明,解有界性条件包含了Melnikov函数为零的混沌判据.通过数值方法揭示了系统长期行为的不可预言性.但是,调节合适的初始条件可以抑制长期行为的不可预言性.在第二章和第三章的基础上,第四章主要研究了阻尼条件下的正常和混沌的Josephson效应.利用Melnikov函数方法给出了混沌的参数区域.在第五章,我们简短地总结和讨论了该文的工作.该文第三章和第四章包含了作者本人的部分原始工作.