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目的 研究胃肠道间质瘤(Gastrointestinal Stromal Tumors，GISTs)预后相关因素，高通量组织微阵列筛选预后标志物，以期为临床准确预测肿瘤侵袭行为、制定术后治疗方案提供参考依据。 方法 收集1986年6月至2001年12月中国医学科学院肿瘤医院收治胃肠道间叶源性肿瘤患者临床病理及随访资料。复阅切片(H&E)，收集相关病理变量，肿瘤准确定位，并两点取材构建组织微阵列。免疫组织化学染色检测CD117、CD34、SMA、Desmin及S-100蛋白等五种抗体表达，CD117表达阳性患者定义为GISTs。候选分子预后标志物共19种。单因素生存率比较采用log-rank检验，Cox比例风险模型进行多因素分析。根据预后结果，验证分析美国国立卫生研究院(National Institute of Health，NIH)推荐GISTs侵袭行为预测标准是否合理准确。 结果 (1)依据GISTs定义，226例患者中，最终确诊为GISTs共计211例(93.4％)。可评价194例患者中，起源于胃GISTs78例(40.2％)，小肠来源58例(29.9％)。(2)所有病例分析，患者1年、3年、5年生存率分别为93.5％、72.1％、63.2％；单因素分析显示，患者的预后与肿瘤部位、肿瘤大小、核分裂像数目、坏死、细胞密集程度、肿瘤细胞类型、核异型性、出血、手术方式、周围脏器组织有无侵犯、黏膜有无受侵、性别、Ki-67标记指数≥5％、p53、Bcl-2、IQGAP1及Grb7蛋白表达等因素有关(P＜0.05)；多因素分析显示肿瘤大小、核分裂像数目、坏死、周围组织肿瘤侵犯、IQGAP1蛋白表达及性别是影响预后的重要因素。(3)在胃间质瘤，患者1年、3年、5年生存率分别为93.2％、80.2％、77.7％，单因素分析显示，当肿瘤直径≥10cm、核分裂像数目≥10个／50HPF(High Power Fields，HPF，高倍视野)、有坏死、核异型、混合型细胞肿瘤、肿瘤细胞丰富、手术不完全切除、黏膜及周围组织受侵、Ki-67标记指数≥5％、p53蛋白阳性表达、男性、年龄≥60岁等因素存在，提