中国加入世界贸易组织后,跨国公司的子公司纷纷进驻中国,无论是国内贸易还是进出口贸易,跨国公司已成为中国贸易的重要组成部分。随着跨国公司利用转移定价开展避税的行为逐渐被人们熟知,海关也开始关注进口商品价格涉及的关联交易和转移定价问题。然而,受限于审价法律与转移定价理论之间的鸿沟,海关审价在面对转移定价问题时,一直难以找到一套行之有效的解决方案,加之包括中国在内的大部分国家海关对转移定价问题的研究时间较短,在审核转移定价案件过程中,普遍存在发现难、审核难和认定难等问题,导致海关的转移定价审价工作进入了一个瓶颈。本文通过对转移定价海关审价过程中难点的分析,借鉴税务部门审核转移定价时使用商业数据库的做法和经验,提出建立以海关进口商品价格、国内再销售价格以及企业财务数据为基础的海关转移定价审核系统。审核系统将毛利率作为审核的核心指标,选取审核系统中已有的企业或商品数据作为参照物,比较判断被审核企业或商品的进口价格是否受到特殊关系影响,是否存在转移定价问题。本文根据审核系统建立的特点,提出近期基于外部商业数据库、中期基于海关自主收集的企业财务数据以及远期基于企业ERP系统相关数据的审核系统建设方案,并结合实际案例对审核系统的数据采集和查询分析功能运用进行验证,提出具体的操作方法。通过对建立和运用海关转移定价审核系统的研究,本文得出以下结论:(1)海关转移定价审核系统是解决关联交易和转移定价审价的有效途径;(2)中国海关已具备建立海关转移定价审核系统的客观条件。本文的可能贡献之处在于,海关转移定价审核系统为海关审核跨国公司转移定价问题提供了一个新思路,大幅简化审核步骤,减少审价耗时,有效解决转移定价海关审价中的核心问题--因缺少行业或商品数据而无法审核或确定涉及关联交易和转移定价的进口商品价格。海关转移定价审核系统还可以与大数据和云计算相结合,将关联交易审核进一步前伸,扩展至进口申报阶段,利用计算机自动判断实现风险预警,提升海关风险防控能力。