猪繁殖与呼吸综合征(Porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的猪的急性或亚急性高度接触性传染病,主要侵害妊娠母猪和未断奶仔猪,具有传播速度快、死亡率高的特点,严重威胁养猪业的健康发展。PRRSV基因易发生变异,产生多种不同变异毒株,给疾病的防控带来很大困难。2006年爆发的高致病性猪繁殖与呼吸综合征给我国养猪业造成巨大打击。目前国内流行的毒株均为美洲型,主要为经典型毒株和毒力较强的高致病性毒株。由于PRRSV不同毒株感染动物后的临床表现、危害程度及其疫苗交叉保护力不尽相同,及时准确鉴定出当前流行毒株对防治猪繁殖与呼吸综合征具有积极意义。猪繁殖与呼吸综合征经典毒株、高致病性毒株、基因缺失弱毒疫苗株(TJM-F92)的Nsp2基因存在部分差异。高致病性毒株和基因缺失疫苗株分别存在90个和450个不连续核苷酸缺失。本研究在其缺失位点两端设计引物,根据扩增目的片段大小不同区分三种不同毒株,建立RT-PCR鉴别检测方法。通过实验证明,该方法具有较好的敏感性、特异性和重复性,对三种毒株的扩增产物大小分别为1 332bp、1 242bp和882bp。使用此RT-PCR检测方法检测吉林、黑龙江等地区68份临床疑似猪繁殖与呼吸综合征病料,发现经典毒株检出率为13.23%,高致病性毒株检出率为20.58%,基因缺失疫苗TJM-F92株检出率为8.82%。本研究建立了PRRSV不同毒株RT-PCR鉴别检测方法,能够检测猪繁殖与呼吸综合征病毒并鉴别其毒株类型,从而区分疫苗免疫猪和野毒感染猪,以及患病猪所感染的毒株种类,为有效预防PRRS、评价疫苗免疫效果以及净化该疫病奠定一定基础。