本文对拟南芥不同U6核小分子RNA基因转录活性进行了分析比较。本研究从拟南芥分离了3个新的U6基因。序列比较分析表明，U6基因均包含上游启动子序列及保守的TATA元件，在应用生物信息学方法将拟南芥U6启动子基因与水稻及人的U6基因进行序列比对时，发现在上游启动子区域，存在一段高度保守序列GCCCATTT，把它命名为‘CAT’框，这段高度保守序列只存在于拟南芥中。‘CAT’框可能是另一个潜在的启动元件。为了解这6个基因的表达模式，将它们的启动子区域与报道基因β-葡糖苷酸酶DNA片段融合后分别转化到拟南芥植株中，利用实时定量PCR技术对转化植株中β-葡糖苷酸酶DNA片段的转录水平进行了分析。结果表明，这些基因的启动子在拟南芥中都具有转录活性，其中U6-26启动子的转录活性高于其它几个基因。这些结果对于研究拟南芥U6核小分子RNA功能具有一定意义。