miRNA、mRNA转录组测序揭示鹅卵泡选择的调控机制

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:CaT614
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禽类卵泡选择是指等级前卵泡库中一部分小黄卵泡被选择进入等级卵泡的发育过程,与禽类的产蛋性能密切相关。颗粒层与膜层是卵泡的主要功能单元,且二者分泌的细胞因子可通过自分泌/旁分泌方式参与调控卵泡选择过程,而颗粒层、膜层在卵泡选择过程中的作用和调控机制还不清楚,阐明卵泡选择机制具有重要的理论意义和实践价值。因此,本研究以天府肉鹅母系母鹅为对象,对选择前(直径4~6 mm的大白卵泡和8~10 mm的小黄卵泡)与选择后卵泡(F5)颗粒层、膜层进行mRNA和miRNA转录组测序分析,筛选影响鹅卵泡选择的关键通路及重要候选mRNAs和miRNAs,构建调控鹅卵泡选择的核心miRNA-mRNA互作网络,揭示鹅卵泡选择的调控机制。取得的主要研究结果如下:1.主成分分析显示,无论是mRNA还是miRNA,颗粒层、膜层样本分布在二维空间的不同区域,与膜层相比,同一发育阶段的颗粒层样品空间分布更为集中。样本间相关性分析表明,颗粒层较膜层样品间相关系数变化范围更大。以上结果提示颗粒层和膜层有明显的功能差异,颗粒层发挥着比膜层更为重要的作用。2.在颗粒层中,卵泡选择阶段(GHF5 vs.GP8)鉴定出2,782个差异mRNAs,是卵泡选择前(GP8 vs.GP4)差异mRNAs数(N=1,524)的2倍左右。在卵泡选择阶段,差异mRNAs主要富集在ECM受体互作、紧密连接、粘附连接、细胞粘附、焦点粘附、脂肪酸消化吸收、甘油酯代谢和类固醇激素生成等生物学过程。对卵泡选择阶段显著变化差异mRNAs构建共表达网络显示,有53、15和13个基因分别与粘附与连接、脂质代谢和类固醇生成相关。大量粘附与连接基因表达量下调有助于降低颗粒细胞间分子屏障而促进卵泡选择后卵黄等物质快速进入卵母细胞,而类固醇生成相关基因的动态表达变化可能与选择前、后卵泡颗粒细胞的分化有关。3.在膜层中,卵泡选择阶段(THF5 vs.TP8)鉴定出415个差异mRNAs,多于卵泡选择前阶段(TP8 vs.TP4)差异mRNAs数(N=20)。与血管形成相关的基因AGTR1、ANGPTL5、NDNF、SRPX2、ACTG2、THBS1、LPAR3、AGTR2 和 FGF13 在卵泡选择过程中显著变化,可能与卵泡膜层血管系统的形成及卵黄等营养物质的输送有关。4.颗粒层GHF5 vs.GP8中鉴定出117个差异miRNAs,是GP8 vs.GP4中差异miRNA 数(N=60)的 2 倍左右。gga-miR-181a-3p、acy-miR-455 等在卵泡选择前显著上调,acy-miR-199、acy-miR-2970、acy-miR-191、acy-miR-138、acy-miR-222 等在卵泡选择后显著变化,而 gga-miR-29a-3p、gga-miR-124a-3p 和 gga-miR-383-5p 等在卵泡选择前、后均显著下调。分析表明这些miRNAs在卵泡选择过程中的动态变化可能与卵泡选择前、后颗粒细胞分化和类固醇激素生成等有关。5.膜层THF5 vs.TP8鉴定出54个差异miRNAs,多于TP8 vs.TP4中差异miRNAs数(N=8)。acy-miR-205、gga-miR-205a在卵泡选择前显著上调,gga-miR-451、acy-miR-144 和 acy-miR-1677 等在卵泡选择后显著上调,gga-miR-10b-5p、gga-miR-135a-5p和gga-miR-211等在卵泡选前、后均显著下调,其动态变化可能与膜层在卵泡选择过程中的功能变化有关。6.通过构建核心miRNA-mRNA互作网络发现,颗粒层acy-miR-2954、acy-miR-218、acy-miR-2970、acy-miR-100、acy-miR-1329、acy-miR-199、acy-miR-425、acy-miR-181和acy-miR-147可能通过影响粘附与连接靶基因的表达水平参与调控鹅卵泡选择过程,acy-miR-138、acy-miR-107、acy-miR-130、acy-miR-128 和 acy-miR-101 可能通过影响脂质代谢相关基因的表达量参与调控鹅卵泡选择过程;膜层gga-miR-15c-5p可能通过影响血管系统形成基因AGTR2的表达量参与调控鹅卵泡选择。综上,颗粒层粘附与连接、类固醇激素生成、脂质代谢相关基因参与调控鹅卵泡选择,膜层血管系统形成相关基因与鹅卵泡选择有关。
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