随着新药研发成本不断上升,制药工业面临着巨大的挑战,迫切需要找到一种有效的方案优化药物研发过程。随着计算机科学的迅猛发展,计算机辅助药物设计成为可能。分子对接技术就是该领域的重要方法之一。本文旨在研究半柔性分子对接算法,即在对接过程中受体分子结构保持不变,配体分子具有一定柔性。要解决的问题包括两方面内容:构象空间搜索算法和打分函数的设计。本文研究分子对接理论、常用构象空间搜索算法、打分函数以及当前主要存在的问题。在此基础上,提出解决方案。首先,为了实现搜索构象空间的全局最优解,提出改进遗传算法IPSGA(Improved Particle Swarm Genetic Algorithm)算法。其次,为了提高计算速度和提高计算精度,提出一种基于力场函数、Gehlhaar势能函数和隐式溶剂模型相融合的打分函数。最后,为了评估算法的对接成功率和精度,选择77个晶体复合物作为测试集,用本算法对其进行对接实验,得到较好的对接成功率和对接精度。