microRNA (miRNA)是一类长度为22nt左右的内源性非编码RNA，通过碱基序列互补配对的方式对靶标mRNA的表达进行调控，从而控制基因的表达。基因的异常性表达成为多种疾病发生的重要因素，因此miRNA对疾病的产生和发展起到了重要的作用。本文是根据现有miRNA-疾病关联数据预测新的疾病关联miRNA。首先，依据miRNA与疾病数据库HMDD中已知的miRNA和疾病关联，同时综合国际医药数据库对每个疾病的标注，我们改进了计算两个疾病间相似性的方法，进而计算两个miRNA间的功能相似性。在此基础上，建立了miRNA功能相似性网络。其次，基于功能相似的miRNA可能调控相似的疾病的前提，我们提出了基于K个最相似邻居的疾病关联miRNA预测方法。此外，我们还考虑了miRNA家族和人类miRNA分簇分布的特点，提出了基于加权的疾病关联miRNA预测方法。基于整个miRNA功能相似性网络的信息，我们还提出了基于随机游走的预测方法。实验结果表明，这三种算法均取得了良好的预测性能。最后我们建立了疾病关联miRNA的预测和分析服务平台，提供了18种人类常见疾病的预测结果。同时，该平台可以进行miRNA-疾病的关联查询和多个miRNA关联疾病的分析，能够为生物学家和同行专家提供实时的疾病关联miRNA预测和分析服务。