论文部分内容阅读
非整倍体是恶性肿瘤细胞重要的细胞遗传特征,存在于大约90%的实体瘤和75%的造血系统肿瘤。非整倍体是癌症发生的驱动者而不是结果,并且非整倍体对细胞健康的影响取决于具体核型和环境条件,因此非整倍体对肿瘤产生的效应是一个复杂的情况。有趣的是,正常细胞出现非整倍体对肿瘤的发生率产生明显的影响,最为明显的是21三体综合征患者的实体瘤发生率降低和白血病的发生率升高,21三体综合征可以作为非整倍体对肿瘤发生率影响的研究模型。本研究将以21三体综合征为研究对象,探索其实体瘤低发和白血病高发的分子机制,以及它们是通过什么方式发挥作用的? 肿瘤细胞具有特定的染色体核型,例如实体瘤中频繁增加的是染色体7、12和20,非实体瘤中频繁获得染色体6、8、10、18、19和21,其中21号染色体在实体瘤中优先缺失但是在非实体瘤中优先获得。流行病学调查研究发现21三体综合征患者的肿瘤易感性改变,表现为患者的实体瘤发生率显著性低于正常人群,但是白血病的发生率显著性高于正常人群,提示正常细胞额外增加一条21号染色体对肿瘤的发生率产生了影响,并且不同的肿瘤类型存在差异性。 大规模流行病学调查研究发现,21三体综合征患者的实体瘤发生率显著性的低于正常人群,最为显著的是乳腺癌、皮肤癌和肺癌。究其根源,21三体综合征患者体内额外增加了一条21号染色体,导致患者体内的平衡被打破,基因的表达量随之受到影响,我们将以21号染色体上的剂量敏感基因为切入点,研究实体瘤低发的分子机制。针对患者临床表型的出现,提出了不同的假说进行解释,如基因剂量不平衡假说和重要区域假说,我们推测这两种假说可能是通过剂量敏感基因发挥作用的。我们收集和分析了21三体综合征患者和对应的正常人群的9种组织或细胞系的300份表达谱数据,筛选在3种或3种以上组织或细胞系均符合基因剂量效应的基因,共获得150个剂量敏感基因。同时,对TCGA数据库中的14中实体瘤的转录组数据进行了差异表达分析,筛选在7种及7种以上的实体瘤中表达量均显著性降低的基因为候选基因。通过整合21三体综合征和肿瘤的表达谱数据,获得14个候选基因符合以上的筛选条件,其中5个基因表达量在乳腺癌、皮肤癌、肺癌和pan-cancer中均显著性低表达。通过查阅文献和相关性分析,发现其中的3个基因在21三体综合征临床表型和实体瘤中同时发挥重要作用。针对没有被研究的2个基因,我们在三种肿瘤细胞系中通过体内和体外实验对其潜在抑癌功能进行了研究。同时,对5个候选基因在乳腺癌中进行共表达分析,共表达基因的功能聚类主要集中在血管发育,提示它们可能是通过抑制血管生成来降低实体瘤的发生。综上,21三体综合征通过基因剂量效应和重要区域中的剂量敏感基因抑制实体瘤的发生。 与21三体综合征患者实体瘤发生率完全不同的是,21三体综合征患者的白血病的患病风险是正常人群的10-20倍,故我们将探索患者白血病高发的分子机制。我们收集和分析了21三体综合征患者淋巴细胞和骨髓组织的6组表达谱数据,筛选在2组和2组以上的表达谱数据均符合剂量效应的基因,共有24个剂量敏感基因。针对白血病高发,我们重点关注白血病中显著性高表达的潜在癌基因。通过整合以上的表达谱数据,我们共获得19个候选基因。通过候选基因表达量与白血病各种临床数据的相关性分析,共有9个基因在绝大多数的相关性分析中存在显著性,其中的5个基因存在相似的靶基因,主要集中在21q22.3区域,提示存在21三体综合征白血病高发的重要区域。 综上,本研究对21三体综合征患者低发实体瘤和高发白血病分子机制进行了研究,通过基因剂量效应筛选候选基因,以剂量敏感基因为研究对象对其进行深入探究,进而解释其分子机制。本研究可能为实体瘤和白血病发病的分子机制提供一种新的研究途径,为肿瘤的预防和治疗提供理论依据,同时,为探讨非整倍体对肿瘤发生的研究提供一种新的视角。