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四倍体马铃薯“合作88”是我国西南地区主栽品种,无论在抗病害、种植面积、经济效益等方面都有着举足轻重的地位。虽然在“合作88”遗传育种研究领域中,已证实其具有PVY、PLRV抗性,但相关基因型的分析研究并没有报道,且马铃薯病毒病对其产量、口感等各方面的影响仅次之于晚疫病。本研究利用建立的“合作88”自交分离群体969个株系,从群体的田间重要农艺性状调查、DAS-ELISA检测、DNA分子标记检测、克隆测序四个方面共同分析“合作88”PVY、PLRV抗性基因的基因型、适用于辅助选育此群体中具有PVY、PLRV抗性基因的株系的分子标记以及适用于PVY、PLRV表型与抗性基因关联分析的分子标记。这为“合作88”抗病毒及自交分离群体的研究提供了参考依据,为马铃薯的育种、生产、遗传变异等方面提供资源。主要结果如下:1.田间表型调查四倍体马铃薯“合作88”自交后代群体969个株系的PVY、PLRV抗性的表型调查汇总结果表明,“合作88”对两种病毒都有很高抗性,按照性状分离结果,其PVY抗性基因的基因型为YYYy,分离方式为染色单体随机分离;PLRV抗性基因的基因型为RRrr,分离方式为染色体随机分离。2.DAS-ELISA检测“合作88”自交后代群体969个株系检测结果显示,携带病毒的株系很少,被PVY侵染的株系有C88-69和C88-1040,被PLRV侵染的株系有47个,其推测的抗PVY、PLRV基因的基因型分别是YYYy和RRrr,分离方式为完全均衡式分离。3.DNA分子标记PVY抗性基因Ryadg的分子标记RYSC3检测的基因型是YYYy,分离方式为完全均衡式分离;抗性基因Rysto的分子标记YES3-3B检测的基因型是YYYy,为染色体随机分离;抗性基因Ry-fsto的分子标记GP122718和GP122564检测的基因型都是YYYy,分离方式是完全均衡式分离和染色单体随机分离。PLRV抗性基因PLRV.1的分子标记Nl271164检测的基因型是RRrr,分离方式为完全均衡式分离;抗性基因Rlretb的分子标记DMB32-11、1367-8a和C2-Atlg42990检测的基因型都是RRrr,存在染色体随机分离和染色单体随机分离两种分离方式。紧密连锁的分子标记RYSC3和标记YES3-3B可分别用于C88自交分离群体PVY抗性基因Ryadg和Rysto的分子辅助选育;紧密连锁的分子标记DMB32-11和1367-8a均可用于C88自交分离群体PLRV抗性基因Rlretb的辅助选育。综上所述,四倍体马铃薯“合作88”的PVY、PLRV抗性基因的基因型分别为YYYy、RRrr。