目前多元化公司作为最普遍的企业组织形式广泛存在。但是,随着时代的发展,多元化公司逐渐暴露出许多自身固有的缺陷和与外界环境诸多不相适应的地方,大量的理论和实证研究都表明,公司多元化往往造成公司价值贬损。因此,深入了解其深层次原因,无论对于我国公司多元化的实际运作,还是对于理论研究的丰富完善,都具有举足轻重的作用和意义。近年来,控股股东与小股东之间的代理问题导致公司价值贬损这一现象逐渐成为研究公司多元化折价的热点之一。本文就尝试通过构建控股股东与小股东之间的代理问题模型,以公司价值作为基本的价值判断依据,来得出公司多元化折价的结果。并据此模型结果,利用我国多年度、大样本的上市公司各种数据,采用国际普遍使用的超额价值分析方法,验证了我国上市多元化公司同样存在折价现象。在上述基础上,通过控股股东的掠夺方式、隶属性质和具体控制方式对公司多元化折价的影响进行实证分析。研究发现在多元化公司中,控制权与现金流权的偏离程度较大,存在着较为严重的控股股东攫取行为。在一定程度上,董事会规模越大则多元化公司业绩越好,独立董事和持股董事的增加同样有利于公司业绩的提高。而相对非政府控制的上市公司来说,政府控制的上市公司其公司价值更低,并且这主要是由低层级政府控制的公司价值更低引起的。论文在研究过程中,借鉴国内外的实证方法,采用SPSS统计方法,并对影响因素做统计回归分析,结果不仅证明了多元化公司中存在的这一代理问题可以有效地解释公司多元化折价的成因,也展示了我国多元化公司的治理结构特征。