禽类传染性疾病严重地影响着禽业生产,采用遗传改良方法提高宿主对病原的遗传抗性,开展抗病育种,是禽病防治的有效途径之一,并有益于家畜生产和人类健康。Mx蛋白和主要组织相容性复合体(MHC)因具有抗病毒作用而备受抗病育种研究者的关注。已有报道,Mx基因编码序列1892位的G/A SNP对Mx蛋白抗禽流感的功能起关键作用;应用分子标记对MHC的基因型进行测定是研究其功能的基础。本研究通过对分布于西亚、南亚和东亚的12个鸡群体378个样本的Mx基因之1892位的单核苷酸多态性的检测和对位于MHC区域内的三个微卫星标记LEI0258、MCW0371和MCW0312的遗传多态性的分析,得出以下结论:1)地方群体中Mx抗病基因型(AA)和抗病基因(A)的频率明显高于商品培育品种。地方群体中,西、南亚群体中Mx抗病基因(A)的频率明显高于中国西北和韩国(东亚)群体,其中以孟加拉(BAN)群体的抗病基因(A)频率最高(77.5﹪),中国西北会宁群体的抗病基因(A)频率最低(11.8﹪)。2) LEI0258和MCW0312基因型测定结果显示,地方群体的遗传多样性大于商业培育品种。地方群体中,西、南亚群体的遗传变异程度高于中国西北和韩国群体(东亚);其中以孟加拉(BAN)的平均多态信息含量和杂合度最高,民勤(MQ)最低。3) MCW0371序列的重复区呈Fr1(An)和Fr2((AAC)mAn)两种模式。Fr1为完全型单核苷酸重复微卫星,Fr2为有两个毗邻的重复单元的复合型微卫星。序列结构复杂,核苷酸长度相同的等位基因存在核苷酸结构不同的可能,因而难以通过片段分析对该基因座进行正确的基因型测定。另外,在其两侧翼序列中还存在多个SNPs和InDels。Fr1模式中检测到6个SNPs和4个InDel;Fr2模式中检测到16个SNPs和4个InDel。Fr2模式的多态性大于Fr1模式。