【摘 要】
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该文以感染两种海水养殖鱼类斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)和眼斑拟石首鱼(Sciaemops ocellatus,俗称美国红鱼)的虹彩病毒为研究对象,对其基因组和分类地位进行研究.基因
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该文以感染两种海水养殖鱼类斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)和眼斑拟石首鱼(Sciaemops ocellatus,俗称美国红鱼)的虹彩病毒为研究对象,对其基因组和分类地位进行研究.基因组测序采用PCR扩增的方法,以已知的传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)的基因组序列为参照设计引物,从染病的眼斑拟石首鱼和斜带石斑鱼中提取病毒模板进行PCR扩增.基因组的部分序列比较结果表明眼斑拟石首鱼虹彩病毒与ISKNV属于同一个种的同一株系,斜带石斑鱼虹彩病毒与ISKNV有很近的亲缘关系.在初步确定了斜带石斑鱼虹彩病毒的分类地位之后,完成了其全基因组测序,用生物信息学的方法,对斜带石斑鱼虹彩病毒的全基因组进行分析.分析结果显示,斜带石斑鱼虹彩病毒(Epinephelus coioides iridovirus,ECIV)基因组为双链线状DNA,全长为112,636bp,共有121个开放读码框,编码42个氨基酸到1168个氨基酸的蛋白质.ECIV基因组中散布着许多重复序列,包括直接重复序列、反向重复序列和回文序列.进化树分析进一步表明斜带石斑鱼虹彩病毒与ISKNV具有很近的亲缘关系,为同一个种的不同株系.
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