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研究目的:本实验研究通过利用高通量测序技术对热疗前后的鼻咽癌CNE-2细胞株进行转录组基因测序，利用IPA(Ingenuity Pathway Analysis)技术对测序结果进行注释、比对，并使用基因本体(Gene Ontology，GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes，KEGG)分析方法对差异表达基因进行功能富集分析，从而探讨鼻咽癌CNE-2细胞株热疗前后基因的差异表达情况及进行功能分析，为下一步研究鼻咽癌热疗的分子作用机制奠定实验基础。 研究方法:将鼻咽癌CNE2细胞分为空白对照组和实验组。实验组CNE2细胞恒温42℃水浴1小时后，置于37℃、5％CO2的培养箱中继续培养24小时。空白对照组不作加温只在37℃、5％CO2的箱中进行培养。然后两组均分别提取总RNA进行文库构建，采用高通量Illumina HiSeqTM2500测序平台对样本进行转录组基因测序，再利用IPA软件进行转录数据的分析，对转录组测序结果进行参考基因组注释、比对，并使用GO（基因本体）和KEGG（京都基因与基因组百科全书）富集分析方法对差异表达基因进行功能富集分析。 实验结果:1.通过采用DESeq软件分析差异表达基因，按|FC｜＞1.5，P-value＜0.05的筛选标准一共筛选出3184个表达差异基因。其中2712个为上调的差异表达基因，472个为下调的差异表达基因。2.差异基因涉及90条信号通路和466个上游调控分子。GO分析结果显示差异表达基因与肿瘤相关的生物过程功能、细胞组成功能、分子功能等相关;KEGG富集分析结果显示以上差异表达基因主要涉及14个信号通路或生化途径，其中参与PI3K-Ak信号通路、MAPK信号通路等通路的基因较多。IPA在经典通路、相互作用网络、上游调控因子三个方面进行分析，分别筛选出IL-8信号通路、NF-κB信号通路等5个信号通路、相互作用网络核心基因CCND1和CDK4/6及上游调控因子SMARCA4、TGF-β1等。 结论:本研究筛选出热疗前后的鼻咽癌CNE-2细胞株差异表达最高的20个基因、5个上游调控因子和评分最高的调控网络的2个核心基因及相关的7条信号通路，为下一步研究鼻咽癌热疗的机制奠定实验基础。