连云港地区结核分枝杆菌耐药性和基因突变位点分析

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目的:  回顾性分析连云港地区2014至2016年期间肺结核患者的结核分枝杆菌药物敏感试验及其对利福平和异烟肼相关耐药基因的检测结果。了解连云港地区结核分枝杆菌的耐药现状和耐药基因的突变情况,为临床有效防治结核病提供参考。  方法:  1. 数据来源:2014年1月1日到2016年12月31日期间,连云港市县结核病防治机构送检疑似肺结核病患者痰涂片阳性标本1747例,分别对患者年龄、性别、初治和复治情况、以及结核分枝杆菌培养和药物敏感试验、耐药基因芯片检测结果进行数据统计。  2. 结核分枝杆菌培养、鉴定和药物敏感试验:痰标本用罗氏培养基培养,结核分枝杆菌的鉴定用对硝基苯甲酸法;比例法药物敏感试验检测对异烟肼(isoniazid,INH)、利福平(rifampicin,RFP)、卡那霉素(kanamycin,KM)和氧氟沙星(ofloxacin,OFX)4种药物的耐药性。  3. 基因芯片分析:对1747例标本利用基因芯片技术分析耐RFP结核分枝杆菌的rpoB基因和耐INH结核分枝杆菌的katG和inhA基因上的突变位点。  4. 统计学分析:采用SPSS20.0软件进行统计分析,计数资料组间比较采用?2检验,P<0.05表示差异具有统计学意义,P<0.01表示差异具有显著统计学意义。  结果:  1. 连云港地区肺结核流行情况:在1747例标本中1307例结核分枝杆菌培养结果阳性,阳性率为74.81%。三年中初治患者总例数为1114例(85.23%),复治患者总例数193例(14.77%)。男性患者总例数为1017例(77.81%),女性患者总例数为290例(22.19%),男女比例为3.51:1(1017/290)。发病年龄1~94岁,平均年龄51.1岁,以年龄21~30岁区间患者人数最多,其次为61~70岁区间。  2. 连云港地区结核分枝杆菌耐药情况:① 2014 至 2016 年总耐药率为16.14%,耐药率逐年下降(20.39%、14.04%、13.55%),?2=9.67,P=0.008<0.05,差异有统计学意义。② 2014 至 2016 年中结核分枝杆菌对四种药物耐药率从高到低依次为INH(9.72%)、OFX(6.27%)、RFP(6.04%)、KM(1.07%),3年间结核分枝杆菌对OFX的耐药率逐年降低(8.58%、5.08%、4.91%),差异具有统计学意义(?2=6.52, P=0.04<0.05);结核分枝杆菌对INH、RFP和KM的耐药率3年中没有统计学差异,但有下降趋势。③ 初治患者所分离的结核分枝杆菌耐药率为14.00%(17.42%、13.39%、10.80%)、复治患者所分离的结核分枝杆菌耐药率为28.50%(37.14%、19.15%、26.32%),明显高于初治患者,?2=25.53, P=0.000<0.05,差异有统计学意义。④ 3年间耐多药率平均为3.67%(3.86%、3.87%、3.27%)和广泛耐药率平均为 0.31%(0.43%、0.24%、0.23%),复治组耐多药率(9.33%)显著高于初治组(2.69%),?2=20.46,P=0.000<0.01。  3. 连云港地区结核分枝杆菌耐药基因的突变情况:① 结核分枝杆菌对RFP耐药突变位点以rpoB531(46.75%)和rpoB526(19.48%)为主;最常见的突变类型为531 (TCG→TTG) 和526 (CAC→TAC) ② 对INH耐药突变位点以katG 315 (78.64%) 为主,最常见的突变类型为315 (AGC→ACC)。  4. 结核分枝杆菌比例法药敏试验与耐药基因芯片法比较:① 两种方法分别检测结核分枝杆菌对 RFP 及 INH 的耐药率均未见显著差异(?2= 0.749,P =0.387>0.05;?2=0.794,P=0.373>0.05)。② 芯片法检测结核分枝杆菌对RFP的耐药性敏感度为80.30%、特异度为97.93%,与比例法药敏试验结果的符合度为96.94%;芯片法检测结核分枝杆菌对INH耐药性的敏感度为63.81%、特异度为97.01%,与比例法药敏试验结果的符合度为94.56%。  结论:  1. 连云港地区肺结核患者人数男性高于女性,21~30岁年龄区间患者人数最多。  2. 2014 年到 2016 年结核分枝杆菌对药物的总体耐药率呈下降趋势,特别是对OFX的耐药率具有统计学差异;复治患者所分离的结核分枝杆菌耐多药率显著高于初治患者。  3. 连云港地区结核分枝杆菌RFP耐药突变位点以rpoB531和rpoB526为主,最常见的突变类型为531 (TCG→TTG) 和526 (CAC→TAC) ;对INH耐药突变位点以katG 315为主,最常见的突变类型为315 (AGC→ACC)。  4. 比例法药物敏感试验和基因芯片法检测结核分枝杆菌对RFP和INH的耐药性结果没有显著差异,基因芯片法可作为早期筛查结核分枝杆菌耐药性的快速有效方法。
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