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食虫目(Insectivora)鼩鼱科(Soricidae)物种是现今为止人们发现的最小的一类哺乳动物,广泛分布于亚、非、欧及南北美洲。现分为鼩鼱亚科(Soricinae)和麝鼩亚科(Crocidurinae)两类。鼩鼱属(Sorex)隶属于鼩鼱亚科。该类动物体型小且隐蔽性强,因此较难捕获,迄今国内相关文献资料相对较少。随着分子生物学的发展,越来越多的学者开始将传统的形态学和系统发育学技术整合在一起并实际应用于物种鉴别,极大程度地加强了对鼩鼱科的分类学研究,并且在鼩鼱科发现新物种和重新描述等研究方面也受到了热烈的关注。然而,由于缺乏线粒体基因组数据,鼩鼱属的亲缘关系和物种分类状况无法在线粒体基因组水平上进行探索。基于2013年至今积累的鼩鼱科标本为基础,本文对扁颅鼩鼱(S.roboratus)、远东鼩鼱(S.isodon)及中鼩鼱(S.caecutiens)以传统形态学和系统发育学相结合,互相印证从而完成物种鉴定。即先利用标本外部形态与头骨特征的对比、描述与测量进行形态学物种鉴定,再利用mt DNA中Cytb单基因完成系统发育树重建,通过计算样本间的遗传距离进行分子生物学物种鉴定,最终得到的形态学和分子生物学物种鉴定结果一致。确定了物种后分别对3种鼩鼱的线粒体基因组进行扩增和测序。将测得的3种鼩鼱线粒体基因全序列上传到NCBI-Gen Bank数据库中,并下载其他9种已知的鼩鼱属物种线粒体基因全序列。将鼩鼱属12种鼩鼱的线粒体基因全序列和Cytb单基因分别进行生物信息学分析,发现并描述了鼩鼱属12种鼩鼱线粒体基因组的共同特征和特化特征,系统地论证了鼩鼱属物种之间的分类和系统发生关系。此外,还分析了鼩鼱属物种线粒体单基因在构建系统发生树中的可靠性。研究结果如下:(1)基于形态学测量数据分析和Cytb基因系统发育树重建,对本研究中3种待测鼩鼱样本进行比较表明:所采用的分子生物学检测标本与其相对应物种的序列(Genbank下载)都能分别聚集在一个小分支上,并表现出与其近缘物种、东北亚分布的其它物种存在明显的系统分化。物种的聚类分析结果与形态学分类鉴定结果一致,与形态学鉴定结果一致。(2)扩增得到扁颅鼩鼱、远东鼩鼱及中鼩鼱线粒体基因组全序列,丰富了鼩鼱属类群的基础生物学信息。扁颅鼩鼱mt DNA序列全长为17 153 bp,远东鼩鼱为17 007 bp,中鼩鼱为17 096 bp,长度差异主要来自于D-loop区。线粒体基因组t RNA的反密码子均完全一致。在编码蛋白的起始密码子和终止密码子中,存在少部分的差异。鼩鼱属12种鼩鼱线粒体基因组均为环形DNA分子,包含13个蛋白编码基因,2个r RNA和1个D-Loop区。苔原鼩鼱(S.tundrensis)和普通鼩鼱(S.araneus)有23条t RNA;其余10种鼩鼱有22条。碱基组成中碱基含量遵循C>A>T>G,A+T>G+C的规律,表现出对AT的偏好,核苷酸组成倾向于AT编码,蛋白编码基因AT含量在3号位密码子一般高于密码子1号位和2号位,ATP8与ATP6基因之间重叠最长(43 bp)。(3)基于鼩鼱属12种鼩鼱线粒体基因组全序列构建的系统发生关系表明:所有鼩鼱属物种均聚集在一个分支;纹背鼩鼱为鼩鼱属最早分化的物种;扁颅鼩鼱与长爪鼩鼱互为姊妹种,中鼩鼱与陕西鼩鼱互为姊妹种,细鼩鼱与姬鼩鼱互为姊妹种。通过线粒体单基因序列构建的系统发生树与串联基因构建的系统发生树比较发现16S r RNA和ND4能很好的还原鼩鼱属的系统发生关系。(4)基于鼩鼱属12种鼩鼱Cytb单基因序列构建的系统发生关系表明:支持鼩鼱属分为新北区亚属(Otisorex)和古北区亚属(Sorex),Gen Bank中已测定mt DNA全序列的12个物种均归属于古北区亚属。