荧光假单胞菌低温噬菌体的分离及特性

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 6次 | 上传用户:liuguoqiangswu
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噬菌体在微生物种群大小和群落结构的调节、营养物质循环等方面起着重要的作用,这在物种多样性较少、食物链较短的低温环境中更为显著。低温嗜菌体研究不仅可以丰富对生命形式的认识,而且在低温菌表达系统人工载体的构建、低温下高活性工业用酶的开发以及分子生物学工具酶等方面都有着广泛的应用前景。此外,作为一种模式系统,低温噬菌体还可用于探索微生物对低温环境的适应性。然而,现有的低温噬菌体资源还相当有限,发现新的低温噬菌体仍是目前首要的任务。本研究通过优化低温噬菌体的分离培养条件,从云南明永冰川地区土壤样品中成功分离得到两株以荧光假单胞菌为宿主的低温噬菌体(cold-active phage),对其基本生物学特性进行了描述,分别命名为pfv1和pfv2,其宿主命名为PF1和PF2,并对pfvl的生物学性质进行了详细研究。对宿主菌进行电镜形态观察、16S rRNA基因进化树构建分析和生长温度范围鉴定。宿主菌有端生鞭毛、好氧,生长温度范围为4℃-28℃,16SrRNA基因序列相似性对比鉴定和系统进化树构建分析表明与荧光假单胞菌亲缘关系较近。本研究从云南明永冰川地区土壤样品中分离到的以荧光假单胞菌为宿主的两株低温噬菌体(cold-active phage)并对其基本生物学特性进行了描述。分离得到的两株低温噬菌体分别命名为pfvl和pfv2,它们的宿主命名为PF1和PF2,并且pfv1噬菌体是首次分离到的复层噬菌体科的低温噬菌体,本实验详细研究pfv1的生物学性质。本研究的主要内容包括以下几个方面:1对宿主菌进行电镜形态观察、16S rRNA基因进化树构建等分析,生长温度范围实验等方面鉴定。宿主菌有端生鞭毛、好氧,生长温度范围为4℃-28℃。通过16S rRNA基因序列相似性对比对菌株进行鉴定,系统进化树构建分析表明,与荧光假单胞菌亲缘关系较近。2噬菌体pfvl可形成圆形透明的噬菌斑,直径可达5mm,出斑时间为11小时;pfv2可形成中间透明边缘模糊的噬菌斑,较长时间培养时,可形成直径1.5cm的晕圈。通过电镜观察,噬菌体pfvl为球形,直径约60nm,初步判断为复层噬菌体,pfv2头部直径约40nm,有一个短的尾部,初步判断为短尾噬菌体。3一部生长曲线表明噬菌体pfv1在15℃温育条件下,10min吸附率可达90%,潜伏期约为1h,裂解量为10pfu/cell。4噬菌体pfv1最佳感染复数为1。5对pfv1限制性酶切长度多态性分析,结果表明基因组大小约为38k。6 SDS-PAGE显示噬菌体pfvl可能有9种外壳蛋白,大小分别为14KDa,20Kda, 24Kda,27Kda,29 Kda,36 Kda,38 Kda,45Kda,48 Kda,65 Kda,80 Kda。本研究首次对明永冰川土壤样品中低温噬菌体进行了分离培养和生物学特性描述,发现了低温噬菌体新资源,获得一些具有应用前景的新功能基因。研究结果有助于揭示明永冰川地区噬菌体分布和微生物生态的特点,并对阐明细菌嗜冷机制也有潜在价值。
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