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栓菌(Trametes)及其近缘属菌物是多孔菌中的重要类群,广泛分布于各种自然环境中。栓菌的一些种在制药与环境治理等方面有重要应用价值。目前对栓菌的分类主要建立在菌丝类型、孢子形态、腐朽类型等形态学基础上,然而有些栓菌及其近缘种拥有较为相似的形态学及显微学结构,因此仅以形态特征作为分类依据有时并不可靠,容易造成分类上的混淆。随着分子系统学的发展,核苷酸序列在系统演化和分类研究中提供了最直接的证据,已广泛用于真菌分子系统学的研究。本研究通过克隆、测序ITS序列和mt SSU rDNA基本全长序列,并结合GenBank数据库中相关的基因序列对栓菌及其近缘属菌物的系统发育关系进行了分析并且分别构建了系统树和生成了相关区域的二级结构,主要结果如下:(1)根据ITS序列和mt SSU rDNA序列所形成的系统树具有良好的一致性,即绝大部分栓菌在系统树上可以聚为一枝,红孔菌属与栓菌属菌物拥有密切的亲缘关系,在系统树中不能与栓菌属菌物完全分开,对两个属菌株二级结构的预测也表现出了高度的相似性。(2)本研究证明雅致栓菌(Trametes elegans)是属于栓菌属的菌株,其与栓菌属聚为一枝且与红孔菌属的关系较近。(3)革孔菌属菌物与栓菌属菌物在以ITS序列和mt SSU rDNA序列所形成的系统树上均能完全分开,其中在以前系统分类学中存在争议的菌物硬毛栓菌(Coriolopsis trogii)可以与革孔菌属菌物聚为一枝且其相关区域的二级结构与革孔菌属菌物相似而与栓菌属菌物有较大不同,因此本研究认为硬毛栓菌不属于栓菌属而属于革孔菌属。(4)一色齿毛菌(Cerrena unicolor)与栓菌属亲缘关系较远,其在系统树中的位置能够与栓菌属菌物完全分开。相关区域二级结构的预测也显示其与栓菌属相差甚远,因此本研究认为Cerrena unicolor不适合作为栓菌群菌物的代表种。(5)对ITS-1及ITS-2区二级结构的预测展现出了与系统树分析结果良好的一致性,ITS区序列碱基构成的变化可能并不对二级结构的变化产生重大影响,利用这一特点可以将一些序列变化较快从而造成序列对位排列困难的菌株进行二级结构预测来解决它们的系统发育问题,对能够正确进行序列对位排列的菌株来说,ITS二级结构的预测也对解决菌物的系统发育问题起到了良好的辅助作用。(6)本研究证明mt SSU rDNA的基本全长序列可以很好的解决栓菌及其近缘属菌物的系统发育问题,该序列较长且具有保守区与可变区,拥有丰富的生物信息学位点,可以很好的解决菌物属间和属内的系统发育问题。可变区的二级结构也具有重要分类学意义,最重要的是由于mt SSU rDNA V4及V6区具有种内的高度保守性和种间的高变异性,从而使得在研究多孔菌系统发育关系时只需研究相关种的一株菌株即可对该菌进行系统发育定位,这将大大节省研究的工作量。