内蒙古汉族人群中TIMP-2基因多态性与膝骨性关节炎遗传易感性的关联研究

来源 :内蒙古医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lllwan1
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目的:膝关节骨性关节炎(knee osteoarthritis, KOA)是一类以膝关节慢性进行性退变为特点的关节疾病,其主要的发病人群为中老年人群,给人类健康带来严重的威胁。KOA的发病机制较为复杂,目前认为年龄、性别、职业、肥胖、遗传和生物力学等因素与KOA的发生有关。最近,有关基因研究发现很多单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism, SNPs)与KOA的发病风险相关。本研究旨在了解内蒙古地区汉族人群中基质金属蛋白酶抑制因子-2(TIMP-2)基因多态性与KOA患病风险的关联性,从而找出影响KOA患病风险位点,为KOA发病机制提供理论支持。  方法:通过病例-对照研究的方法,选择2014年12月至2016年7月在内蒙古地区医院就诊的KOA患者样本300例。同时期,采集医院健康体检中心的健康人群428例,作为对照组。病例-对照中的样本分别提取DNA。通过PubMed数据库和Web of Science等数据库检索关于KOA患病风险的全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)和其它大样本关联分析研究的文献,从中挑选出与KOA患病风险相关的基因,在基因上选取SNPs位点,应用MassARRAY分型技术对选定的SNPs位点进行基因型频率的检测,并选用卡方检测和SNP Stats分析等软件对实验所得的各种遗传模型结果进行统计学分析。  结果:经过数据库查询,筛选出与 KOA患病风险相关的 TIMP-2基因。选取此基因上6个SNPs位点进行病例-对照样本的检测。通过300例KOA患者与428例健康对照组的比较发现,TIMP-2基因上rs7342880位点的“A”等位基因频率分布有显著性差异(相对优势比(odds ratio, OR)=1.44,95%置信区间(confidence interval, CI)=1.09-1.91, p=0.011);TIMP-2基因上rs4789936位点在超显性模型下,基因型频率的分布存在统计学意义(OR=0.69,95%CI=0.49-0.98,p=0.036)。经性别和年龄矫正后,上述差异仍然存在,说明差异的产生与rs7342880、rs4789936位点的基因型频率在内蒙古地区汉族人群的分布有关。此外,我们发现在内蒙古地区汉族人群中rs2277698, rs2009196, rs11654470, rs2003241位点的基因型频率与KOA的患病风险不存在统计学差异(p>0.05)。同时,我们利用Haploview软件构建单体型,检测6个SNPs之间的连锁不平衡关系,发现rs2277698, rs2009196, rs7342880, rs11654470之间存在共同遗传的关系,经无条件Logistic回归分析后发现以上4个SNPs之间构成的单体型与KOA的患病风险无统计学意义(p>0.05)。  结论:在内蒙古地区汉族人群中,TIMP-2基因多态性与KOA患病风险存在相关性。(1)TIMP-2 rs7342880位点的“A”等位基因携带者可能会增加KOA的患病风险;(2)在超显性模型下,rs4789936位点携带者可能会显著降低患KOA的风险;(3)rs2277698, rs2009196, rs11654470, rs2003241位点多态性与中国内蒙古地区汉族人群KOA发病风险无相关性;(4)在单体型分析中,我们发现TIMP-2基因上6个位点形成的单体型与KOA患病风险不存在关联性。
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