二十一世纪以来,创新开始成为促进社会结构转变与经济发展的主要推动力,国家对于不同产业的创新更加重视,相应制定了各种税收优惠政策,旨在为企业研发创新活动提供保障。研发费用加计扣除政策就是其中一项重要的组成部分,特别是自财税[2015]119号文件实施以来,该政策愈发成熟完善,逐渐成为一项普惠性的税收优惠政策,其税收政策效应引起了各界的广泛重视。本文学习了国内外学者的研究方法,以熊彼特创新理论、市场失灵理论、税收激励理论为基础,运用实证研究与案例研究相结合的方法对研发费用加计扣除政策与制造业企业绩效的关系、影响机制、异质性效果进行了研究。据此得出以下结论:（1）研发费用加计扣除政策对制造业企业绩效有正向的积极影响,且对非国有企业的效果更加显著。（2）研发投入、成本费用利润率、创新产出在加计扣除政策与制造业企业绩效中发挥着重要的中介作用。（3）Y公司在执行研发费用加计扣除政策后,获得了一笔客观的税收收入减免,其研发投入、创新产出、成本费用利润率、企业绩效均出现了不同程度的提升。根据以上的结论,本文做出以下建议:对于企业而言,继续增加研发投入,提高政策运用效率,充分利用加计扣除政策带来的税收优惠;对于政府而言,提升加计扣除的比例,特别是对非国有企业的加计扣除比例,同时,对于特定行业的研发费用加计扣除政策,实行特定的加计扣除比例。