HPV分型检测寡核苷酸芯片的初步研究

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背景人类乳头状瘤病毒(Human papillomavirus, HPV)属于Papovaviridae家族,是一种双链环状DNA病毒,大小约8000 bp,目前已发现了200多种亚型。HPV感染是宫颈癌发生的主要病因,持续高危型HPV的感染是癌前病变和浸润性宫颈癌发展的必要因素。由于不同亚型HPV的致病机制和致癌危险性各不相同,因此对HPV各亚型进行分型检测有重要的临床意义。目前,临床上对HPV进行分型检测主要依靠荧光实时PCR技术,但该方法检测通量低,一个反应管中只能检测一个亚型,难以满足临床上同时检测多个亚型的需要。本研究探讨了利用寡核苷酸芯片技术同时检测HPV多个亚型的可能。目的建立带有不同亚型HPV L1基因片段的哺乳动物细胞克隆;在此基础上初步探讨利用寡核苷酸芯片技术对HPV的分型检测的可能。方法1、建立带有不同亚型HPV L1基因片段的哺乳动物细胞克隆用做标准阳性对照。2、收集NCBI数据库中的HPV各亚型的序列信息,设计相应的探针。3、利用基因芯片技术及荧光定量PCR方法对HPV进行分型检测。结果1、成功克隆了30个宫颈癌相关亚型HPVL1基因片段,成功构建并筛选出6个携带有HPV各亚型L1基因片段的细胞株。2、初步制备出可以分型检测HPV的寡核苷酸芯片并建立了相应的检测方法。结论应用重叠延伸PCR的方法,成功克隆了30个宫颈癌相关亚型HPVL1基因片段并构建6个携带有HPV各亚型L1基因片段的细胞株;初步初步制备出可以分型检测HPV的寡核苷酸芯片并建立了相应的检测方法。
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