8q24,ITGAG基因和SLC22A3基因上6个SNPs与宁夏人群前列腺癌的关联性研究

来源 :宁夏医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zxblovezxh
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目的:探讨6个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms SNPs)位点rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)基因型及其构建的单体型与中国北方宁夏人群前列腺癌(PCa)的相关性。并且研究各多态性位点与前列腺癌(PCa)临床病理特征的相关性。方法:采用病例-对照研究的方法,收集来自宁夏银川附属医院泌尿外科前列腺癌患者123例,年龄范围为46-92岁,平均年龄72.1±7.28;选择年龄相匹配的健康体检者136例作为对照组,年龄范围为46-93岁,平均年龄70.4±7.6岁。应用聚合酶链式反应-高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)技术,分析rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)6个SNPs各等位基因型在病例对照组中分布,并应用SHEsis软件构建单体型。利用χ2和OR(OddsRatio)检验分析各SNP及其单体型与宁夏汉族老年前列腺癌的相关性,并分析各位点的基因型分布与前列腺癌床病理特征的相关性。结果:1. rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)5个SNPs病例组与对照组之间,各等位基因型频率差异具有统计学意义(P<0.05)。rs12621278G等位基因在两组中的分布频率分别为21.1%和31.1%,G等位基因在病例组中的分布频率明显低于对照组,差异有统计学意义(OR=1.695,95%CI=1.077~2.669,P=0.022);rs9364554CT基因型在两组中的分布频率分别为52.6%和38.6%,CT基因型在病例组中的分布频率明显高于对照组,差异具有统计学意义(OR=0.549,95%CI=0.304~0.990,P=0.045);rs13252298GG基因型在两组中的分布频率分别为7.4%和18.7%,GG基因型在病例组中分布频率明显低于对照组,差异具有统计学意义(OR=2.857,rs1325229895%CI=中1.106~7.382,P=0.026);rs10090154TT基因型在两组中的分布频率分别为7.1%和0.0%,TT基因型在病例组中的分布频率明显高于对照组,差异具有统计学意义(P=0.001);rs7837688GT基因型在两组中的分布频率分别为33.6%和23.3%,GT基因型的分布频率病例组明显高于对照组,差异具有统计学意义(OR=0.564,95%CI=0.322~0.987,P=0.044);rs7837688T等位基因在两组中的分布频率分别是22.5%和14.0%,T等位基因在病例组中分布频率明显高于对照组,差异有统计学意义(OR=0.557,95%CI=0.351~0.885,P=0.013);rs1447295基因型和等位基因频率在两组中的分布差异无统计学意义(P>0.05)。2. rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)的基因型频率在前列腺癌患者中在年龄、Gleason评分、PSA浓度、吸烟及饮酒分布均无统计学意义(P>0.05)。3. rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)构建的单体型中有6个单体型在人群中的频率超过3%,其中TATT单体型在病例组和对照组中的频率分别为4.7%和0.0%,分布差异具有统计学意义(OR=319.301,95%CI=19.624~5195.447,P=0.006);TACG单体型在病例组和对照组中的频率分别为0.0%和3.5%,分布差异具有统计学意义(P=0.013);CATT、CCCG、CCCT和TCCG单体型在病例组和对照组中的频率分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论:1. rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)5个SNPs可能与宁夏汉族老年男性前列腺癌发病风险具有相关性,rs1447295(A/C)与宁夏汉族老年男性前列腺癌发病风险无相关性。2. rs12621278(G/A)、rs9364554(C/T)、rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)与宁夏汉族老年男性前列腺癌诊断年龄、Gleason评分、PSA浓度、吸烟及饮酒均无相关性。3. rs13252298(A/G)、rs1447295(A/C)、rs10090154(C/T)和rs7837688(G/T)构建的单体型中TACG和TATT单体型可能是宁夏汉族男性前列腺癌的危险因素。目的:探讨XPA和XPD DNA修复基因单核苷酸多态性(single nucleotidepolymorphisms SNPs)rs1800975和rs13181及基因-基因互作与宁夏汉族男性不育的相关性。方法:采用病例-对照研究方法,于2010年9月~2012年12月分别收集经由宁夏医科大学第一附属医院生殖检验科确诊的男性不育患者353例,年龄22~40岁,平均年龄(32.1±4.3);健康且生育史的对照组388例,年龄24~40岁,平均年龄(30.6±3.4)。病例和对照年龄相差5岁以内进行群体匹配。所有对象均为久居宁夏地区的汉族。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction–restrictedfragment length polymorphism, PCR-RFLP)方法检测各位点基因型,应用SHEsis在线软件构建单体型,利用χ2和OR(Odds Ratio)检验分析各SNP宁夏汉族男性不育的相关性;并分析XPA基因rs1800975与XPD基因rs13181的交互作用与宁夏汉族男性不育的相关性。结果:XPA基因rs1800975(A> G)AG基因型相比AA基因型的分布频率在病例组和对照组中的分布无统计学意义(OR=1.073,95%CI=0.757~1.521,P=0.692),GG基因型相比AA基因型的分布频率在病例组和对照组中的分布无统计学意义(OR=0.973,95%CI=0.640~1.478,P=0.898)。A、G等位基因的分布频率在两组中的差异无统计学意义(OR=0.990,95%CI=0.807~1.214,P=0.921)。XPD基因rs13181(T>G)GT基因型相比较TT基因型的分布频率型在病例组和对照组中的分布无统计学意义(OR=0.886,95%CI=0.589~1.333,P=0.562),GG基因型相比较TT基因型的分布频率型在病例组和对照组中的分布无统计学意义(P=0.067)。T、G等位基因的分布频率在两组中的差异无统计学意义(OR=0.805,95%CI=0.549~1.181,P=0.267)。结论:XPA基因rs1800975和XPD基因rs13181与男性不育的发病风险不存在关联性,可能不是宁夏汉族人群男性不育的遗传易感因素。
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