大鹏新区,作为深圳市较为年轻的区域之一,近年来在经济社会建设方面做出了突出贡献。随着深圳市改革步伐的加快,对大鹏新区行政运行机制的转变提出了新的要求。本文以深圳市大鹏新区为研究案例,通过探讨其行政运行机制中存在的问题,为大鹏新区行政运行机制的优化改进提供有针对性的对策,也为未来城市功能新区经济与社会的进一步发展提供思路。本文采用实地调研法,以政府职能理论、有限政府理论为支撑,分析了大鹏新区现行行政运行机制中存在的不足,即管委会管理、财事权划分、人员配置这三个层面的问题。具体表现为统筹能力不足、横纵向职能配置失衡、财权事权不匹配、人员编制不合理等问题;并以政府职能理论为分析工具,剖析了这些问题产生的原因,主要包括管委会运行中存在的制度性障碍、各部门之间存在的同构性障碍及利益障碍。最后,本文针对性地提出从完善管委会运行的制度环境,构建人、事、财相统一的协作机制及强化事权明确、职责一致的监督制约机制这三个方面来优化与改进大鹏新区行政运行机制。籍此也可进一步为城市功能新区的行政运行机制的优化提供可行性的经验借鉴。