行政事业单位作为我国政府机构组织,主要职能通过利用国家资产进行民生民计的建设,更好地服务人民群众。我国近些年来加强了预决算的管理并进行了相关的一系列改革,虽然改革有了一定的成效,财政预算的约束力也有了加强,但是目前我国对于财政收支的预决算方面还是缺乏更有力的监察,这使得预决算偏差的问题越来越严重,因此对于行政事业单位进行更加科学、规范的管控越发受到重视。行政单位内部控制是一个集合了控制流程、机制与制度的体系,建立该体系的目的是为了杜绝舞弊、浪费、滥用职权、管理不当等行为,保证行政事业单位有效履行公共受托责任。国家近几年对于行政事业单位的内部控制的建设越来越重视,不仅仅制定了规章制度对行政事业单位的内控体系的建设进行指引,更是投入了大量的精力和人力来研究和完善行政事业单位的内部控制。预算业务作为内部控制体系中的关键组成部分,全面预算管理为单位内部的各项业务提供了资金保障,提高了财务管理水平,对于舞弊和腐败等现象进行了有效的控制,使得有限的资金得到了有效的利用,促进了单位的稳定发展,使得社会经济效益得到显著提升,因此全面预算管理的实施效果直接关系到单位整体内部控制体系的运转效率。本文从预决算偏差的管理与控制的角度出发,揭示在此过程中,内控体系对于全面预算管理的重要意义,如何以内控体系的全面提升,来促进行政事业单位以全面预算管理为代表的一系列财政资金的有效管理。本文选取了 G行政单位为例,首先运用文献研究的方法对理论的部分进行了阐述,主要介绍了内部控制的概念、内部控制的发展历程、政府的预决算概念、预决算在内部控制体系中的作用和预决算偏差率的概念。接着采用案例研究的方法分析了 G单位的预决算业务的流程以及2017-2019年的预决算数据,得出在建立和运行内部控制体系前后的预决算的偏差率的确存在着变化的结论,详细分析得出虽然基层行政事业单位存在预决算偏差有其一定的合理性,但是在内部控制制度的建设和运行方面出现的问题也导致了预决算产生一定的偏差。通过对G单位内部控制体系建设以及内部控制制度执行情况的分析,得出G单位在单位层面、业务层面、自我评价和监督层面分别存在着内部控制环境薄弱、单位的内部控制人才严重短缺、信息化程度不高,横向沟通不畅、风险意识不强,没有全局观念、预算控制比较薄弱、财务部门监督能力受限、缺乏必要的内部审计和监督机制、外部监督不完善,流于形式等一系列问题。针对存在的问题结合内部控制理论,提出了增强内部控制意识,营造良好的内部控制环境、加强人员培训,提高综合素质、加强信息化建设,提高横向沟通效率、强化风险意识,制定风险应对措施、进一步完善部门预算制度,强化预算控制、加强财务部门的监督能力、完善内部自我评价体系、加强外部监督机制的建议。希望通过对于G单位的内部控制体系和运行情况的研究,为基层行政事业单位缩小预决算偏差以及内部控制体系的建设提供一定的借鉴意义。