PGAM2基因启动子区变异鉴定及其与猪肉系水力的相关性研究

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dragoonzj
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系水力(water holding capacity,WHC)是指猪肉在施加外力的条件下保持水分的能力,是衡量猪肉质性状的重要标准之一。提高系水力可以避免猪肉中水分的大量流失,减少生产者在经济利益上的损失,同时可以改善猪肉的品质和风味。糖酵解途径是影响系水力高低的关键因素之一,磷酸甘油酸变位酶(phosphoglycerate mutase,PGAM2)、磷酸化酶激酶(phosphorylase kinase gamma 1,PHKG1)和乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase A,LDH4)基因编码糖酵解途径中的关键酶,并且研究表明这三个基因与多个肉质性状密切相关,它们可能通过糖酵解途径影响到系水力。因此,本实验以PGAM2、PHKG1和LDHA基因作为候选基因,筛选启动子区的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位点,研究基因启动子区SNP位点对基因表达水平的影响,及其与系水力的相关性,旨在寻找与系水力相关的分子遗传标记。本实验首先选取了系水力高组和低组各14个样品,通过对三个候选基因表达水平的分析,发现PGAM2和PHKG1基因的表达与系水力水平呈负相关(p<0.05)。将高组和低组的DNA样品进行混池,通过比较测序,在PGAM2启动子区发现一个突变位点c.-360 T>C,其等位基因在高组和低组之间的分布呈显著差异。通过等位基因特异性PCR技术(AS-PCR)对PGAM2基因c.-360T>C位点在170头三元杂交猪中进行了基因分型,获得CC,TT和CT三种基因型。统计分析表明,CC型个体的系水力显著低于TT型个体(p<0.05)。基因表达分析表明,CC型个体PGAM2基因表达水平显著高于TT型个体(p<0.05)。通过双荧光素酶活性分析同样显示,CC型的启动子活性显著高于TT型(p<0.05)。通过转录因子预测,发现SNP位点c.-360C可以结合CREB,TAXCREB和v-Maf三种转录因子,c.-360T可以结合LTSM一种转录因子。最后,通过对不同基因型样品中乳酸含量的测定和pH值的比较得出,与TT型比较,CC型样品中含有较高的乳酸含量和较低的pH值(p<0.1)。结论:本研究在糖酵解关键基因PGAM2启动子区筛选到猪肉系水力相关的突变位点c.-360T>C,不同基因型个体间PGAM2基因表达水平存在显著差异。研究结果提示,该突变位点可作为提高猪肉系水力的遗传标记。
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