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豹猫(Prionailurus bengalensis)是世界分布广泛的濒危物种之一,分布于孟加拉、印度和泰国的指名亚种(P.b.bengnnesis)种群被《濒危野生动植物种国际贸易公约》(Conventions on International Trade of Endagered Species of Wild Fauna and Flora,CITES)列为附录Ⅰ物种,其余各地种群均被列为附录Ⅱ物种。中国濒危动物红皮书将其列为易危种。为探讨豹猫种群的遗传结构与地理分布的关系,本研究对豹猫的线粒体细胞色素b基因和控制区序列进行了分析。获得了来自5个地区的25只豹猫的线粒体细胞色素b基因全序列,均长1140bp。分为12个单倍型,共有24个位点呈现变异,其中12个简约信息位点。4个A-G转换,20个T-C转换,没有颠换发生,表现出高的转换偏倚。没有缺失或插入。单倍型间的序列差异为0.09%～0.89%,种群间核苷酸歧异度Dxy为0.94%～7.64%。 另获得了41只豹猫的线粒体DNA控制区全序列,发现该序列具有长度多态性,大小1493～1630bp。整个控制区序列中存在2个重复序列,5’端重复序列为80～82bp的2～4个串联重复;3’端重复序列为8bp(TACACGTA或CACACGTA)的33～43个串联重复。各保留第一个重复单元后序列分析显示,共存在37种单倍型,具有168个多态性核苷酸位点,简约信息位点104个。117个转换和45个颠换,6个插入/缺失。南北种群特异变异点10个。单倍型多态性Hd为0.9905,核苷酸多样性π为0.0255,核苷酸差异平均数k为28.647。黑龙江种群与南方各种群间的核苷酸歧异度Dxy介于2.524%～2.768%之间。 综合分析不同地理种群的两组DNA数据,结果显示,所研究5个地理区域的豹猫先分为2个进化支,正好分别对应于南北两大种群。南方种群内部又分为两支。北方种群与南方各种群分化显著,但序列差异分析显示还没有达到种的分化水平。北方种群同南方各种群之间没有基因流,出现了地理隔离。南方各种群遗传多样性水平较高,且存在广泛的基因流。