受人类基因组研究所取得的巨大进展的影响和启示,动物基因组学的研究已展现出光辉灿烂的前景。与人类基因组研究不同,动物基因组的研究与经济性状有关的染色体区域、目标是要精细定位畜禽中控制重要经济性状位点在遗传图谱中的位置,并利用这些信息来改良畜禽品种。本文正是基于这样的背景,采用微卫星标记,对鸡进行基因组扫描,寻找影响鸡重要经济性状的染色体区域,探索一条DNA分子标记辅助选择进行动物分子育种的途径,并为构建高密度的遗传图谱以及将来能够进行以图谱为基础的基因型选择奠定基础。本研究利用固始鸡和安卡鸡为试验素材建立参考家系,采用F2代设计方法,建立了正反交7个家系,849只性状分离个体。在第三条染色体上选取了10对微卫星标记对这些个体进行扫描。用Cervus2.0软件分析结果显示10个多态标记的等位基因数为2-5个,杂合度为0.483-0.706,多态信息含量为0.367-0.653。10个微卫星标记均有较高的多态信息含量,为该资源群体从分子水平上的研究提供了可靠的依据。对实验群体的的肉质性状表型数据、屠体性状表型数据、生长性状表型数据以及血液生化指标进行了描述统计分析。相关分析的结果表明各表型值存在一定程度的变异,为数量性状QTL的定位提供了保障。采用SAS统计软件中的非均衡数据的方差分析对标记座位与各性状指标间是否存在显著性差异进行了分析,检测到的10个标记中有7个标记与肉质性状指标间差异显著;10个标记与屠体性状、生长性状以及血液生化指标间存在不同程度的相关。用QTL Express在线分析软件对各性状间进行QTL定位分析, QTL定位结果显示:肉质性状检测到了1个QTL,103cM处检测到了影响脂肪含量的QTL。生长性状检测到了20个QTL,分别为:143cM处检测到了影响12周胫长的QTL;274cM处检测到了影响8周胸深的QTL;104cM处检测到了影响4周胸角和8周体斜长的QTL;253cM处检测到了影响4周体斜长的QTL;103cM处检测到了影响12周胸角的QTL;146cM处检测到了影响12周胸骨长和12周体斜长的QTL;243cM处检测到了影响4周骨盆宽的QTL;255cM处检测到了影响4周胫围、8周胫围、4周胸骨长、8周胸骨长以及0-12周体重的QTL;屠体性状检测到了8个QTL,分别为:255cM处检测到了影响全净膛重、半净膛重、胰腺重、胸肌重、腿肌重、屠体重的QTL;59cM处检测到了影响翅重的QTL;111cM处检测到了影响肌胃重的QTL;血液生化指标中检测到了5个QTL,分别为:162cM处检测到了影响γ-谷氨酰转肽酶的QTL;67cM处检测到了影响碱性磷酸酶的QTL;59cM处检测到了影响胆碱脂酶的QTL;216cM处检测到了影响高密度脂蛋白的QTL;142cM处检测到了影响肌酸磷酸激酶的QTL。