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目的探讨血清HBeAg表达和线粒体DNA D-Loop区突变的关系及其在肝细胞性肝癌发生中的作用。方法选取于2007年1至12月期间在广西医科大学第一附属医院肝胆外科行手术治疗切除的40例肝细胞性肝癌患者的肝癌组织和癌旁组织,同期选取8例肝外伤患者的正常肝组织作对照。用聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)结合直接测序方法检测样本组织线粒体DNA D-Loop区序列,同时应用酶联免疫吸附(Enzyme Linked Immunosorbent Assay,ELISA)方法检测肝癌患者血清HBeAg表达。结果使用DNAstar软件将肝癌组织和癌旁组织以及正常肝组织线粒体DNA D-Loop区测序结果与线粒体DNA数据库比对后得出:1.共发现123个核苷酸位点发生碱基变异,核苷酸位点总变异率为11.0%(123/1 122),提示线粒体DNA D-Loop区具有高度可变性。2.发现2个新多态性位点:NT 228 G→C和NT 16 092 T→A。3.共发现34个核苷酸突变位点,其中16个位点发生点突变,5个位点发生插入,13个位点发生缺失。在16个点突变中主要是T→C、G→A,占50.0%(8/16)。4.肝癌组织线粒体DNA D-Loop区突变率为40.0%(16/40),癌旁组织线粒体DNA D-Loop区突变率为10.0%(4/40),正常肝组织线粒体DNAD-Loop区突变率为0.0%(0/8),差异有统计学意义(p<0.05)。5. 40例肝细胞性肝癌患者中HBeAg阳性21例,占52.6%(21/40),HBeAg阳性同时线粒体DNA D-Loop区突变12例,HBeAg阳性的肝癌组织线粒体DNA D-Loop区突变率高(p<0.05)。结论1.线粒体DNA D-Loop区是一个具有高度多态性和突变性的区域,在肝细胞性肝癌组织中突变率较高。2.肝细胞性肝癌癌旁组织线粒体DNA D-Loop区突变率达10.0%,提示肝癌癌旁组织分子水平的癌前病变。3.血清HBeAg阳性肝细胞性肝癌线粒体DNA D-Loop区突变率高。