随着国家级高新区数量的不断增加，高新区之间竞争越来越激烈。新的高新技术企业所得税优惠政策的颁布，也缩小了高新区与其它区域之间的优势。因此，建设郑州高新区创新体系，已成为高新区健康可持续发展的必然选择，也是贯彻落实国家科技部门的要求。目前，针对郑州高新区创新体系建设的研究还没有，在此背景下，深入研究郑州高新区创新体系建设的意义显得尤为重要。本文主要运用比较法、系统法、调查法、归纳法等相关研究方法对郑州高新区创新体系建设进行深入研究。首先总结国内外研究现状，分析了区域创新体系内涵、构成及运行机制，列举了国内外科技园区创新体系建设特点。然后对郑州高新区创新体系现状进行分析，主要是从创新源泉、企业主体地位确立、创新服务体系、创新投入多元化、创新环境五个方面。通过与国内外科技园区创新体系建设进行比较，归纳出郑州高新区创新体系建设存在的问题及不足，主要表现在人才结构失衡、创新资金投入不足、企业创新能力偏弱、各主体之间的协调性和互动性不强、创新服务体系不健全以及有利于创新的政府职能发挥不足。分析了郑州高新区创新体系建设内外部环境，提出高新区创新体系建设应注重四个方面的原则和建设设计。最后针对建设过程提出相应的保障措施，即强化企业的创新主体地位、加快产业集群建设、实施科技创新平台战略、完善资金支撑体系完善、政府保障作用的发挥等方面。