汤斌的理学思想非常丰富和宏深。从学术渊源上讲，他的理学思想经历了一个前期到后期的变化，在前期，他的理学思想主要以“陆王”为主，同时也不薄“程朱”；在后期，出现了一些变化，呈现出“学兼朱陆，更重程朱”的特点。这种变化既源于他对程朱、陆王两家之学的深刻认识，同时外界环境的变化也对其起到了重要的作用。汤斌认识到，程朱理学和陆王心学都是对道统的继承和发展，都在自己所处的那个历史时代扮演过有非常重要意义的角色。随着时间的推移，种种弊端渐渐产生，不过弊端产生的原因在于两家之学的末流，并非两家之学各自的开创者。汤斌的授业恩师孙奇逢对汤斌前期思想的形成产生了巨大的影响。汤斌晚年的从政生涯则对他后期的理学思想产生了重要影响。汤斌理学思想的内涵主要包括“心体天机、性具善理、圣学存心、知行并进、注重力行”等几个方面。他认为心体原本就是天机，天机即天理，天理周流于万事万物，天理在人则表现为心性，而心性则是人最根本之物，在人的心性之中，是具有善理的，人性善是人躬行实践的最有力保障，人们要努力发明自己的内心，因为内心中本有天理，同时也要注重于日用人伦之中探求天理，因为天理是周流于万事万物的，他特别反对讲学，认为讲则必有异同，有异同则会产生门户的偏见。汤斌在自己的理学思想的指导下，走上了“内圣外王”的道路。在个人内在修养方面，他重视自己的修身养性功夫，修习“静”与“敬”的功夫，认为俭可以养德，为政必廉洁，反对名与利，重视孝道。孝在汤斌那里是一个有着特殊意义的概念，它不仅仅关乎着个人的道德品质还决定着一个人的应事接物的方方面面，甚至关系到一个国家的社稷安危。在外王方面，他勤政爱民，廉洁奉公，足智多谋，深得百姓的爱戴，被百姓亲切地称为“豆腐汤”，也深得康熙帝的赏识，官至礼部尚书，死后被赐“文正”谥号，从文庙。