本研究以UCP3基因作为控制猪生长性状的候选基因,在5个品种(宁乡猪、大围子猪、杜洛克、长白、大白猪)中,采用错配PCR和聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)对UCP3基因3′端非翻译区四个不同变异位点进行了基因分型,分析了各位点的基因频率与基因型频率,分析了各基因型对杜洛克、长白、大白猪生长性状的影响,并研究了错配PCR检测SNP的准确性问题,得出如下结论: 1 23bp处的SNP在宁乡猪、大围子猪中只有CC型一种基因型;在长白猪中只有AA型一种基因型:在杜洛克、大白猪中,有AA、AC、CC三种基因型,等位基因A的频率分别为0.7011、0.8349,等位基因A是优势基因。该位点的变异对UCP3基因的功能不产生显著影响,对杜洛克和大白猪的生长性状不产生显著影响。 2 207bp处Tag Ⅰ酶切位点的变异在杜洛克猪中只有TT型一种基因型;在宁乡猪、大围子猪、长白猪、大白猪中有TT、Tt、tt三种基因型;在长白猪和杜洛克猪中,等位基因T为优势基因,其基因频率分别为0.795和1,而在宁乡猪、大围子猪和大白猪中,等位基因T和t的频率比较接近。该酶切位点的变异对长白和大白猪的生长性状不产生显著影响。 3 428bp处Ec088 Ⅰ酶切位点的变异在宁乡猪、大围子猪、长白、杜洛克、大白猪中都有EE、Ee、ee三种基因型分布;宁乡猪、大围子猪和杜洛克猪三品种间的基因型分布差异不显著(p>0.05),但它们的基因型分布与长白猪的基因型分布差异极为显著(p<0.01);只有杜洛克猪的等位基因E的频率略小于等位基因e的频率,在其余四品种中,都是等位基因E的频率大于等位基因e的频率。在外来品种中EE基因型个体的背膘厚显著低于ee型个体的背膘厚;EE基因型个体的生长性能指数显著高于ee型个体的生长性能指数,选择EE型能降低背膘厚,提高生长性能指数。 4 430bp处Bsh1236 Ⅰ酶切位点的变异在宁乡猪、大围子猪、长白、杜洛克、大白猪中,都有BB、Bb、b6三种基因型分布。在各品种中等位基因b都是优势基因。bb基因型的背膘厚显著低于BB型的背膘厚;bb基因型的生长性能指数